空間的異質性は,肝細胞がんにおける治療反応と臨床結果を予測する進化の特徴を示している

科学分野:

• 腫瘍学
• ゲノミクス
• 翻訳医学

背景:

• 肝細胞癌 (HCC) は,腫瘍内における有意な異質性によって特徴づけられる.
• HCC腫瘍内のトランスクリプトミックの違いを理解することは,患者の経路と疾患の進化を予測するために不可欠です.

研究 の 目的:

• HCCにおける腫瘍内トランスクリプトミックの異質性を利用して,患者のアウトカムを予測するシグネチャーを開発できるかどうかを調査する.
• HCCの予後評価のために,HCCEvoSig (HCCCの進化シグネチャー) を開発し,検証する.

主な方法:

• 4つのHCCコホート (172個のサンプル,37人の患者) で定量化されたトランスクリプトミックの異質性.
• シングル・セル・トランスクリプトミック・プロフィール (110,817 細胞, 34 標本) を用いて検証された異質性および空間的動力学.
• 6つのクロスプラットフォームのHCCコホートでHCCEvoSigを開発し,評価しました.

主要な成果:

• HCCEvoSig遺伝子は,HCCの予後に関連する遺伝子セットに富んだ,腫瘍内および腫瘍間における有意な発現変化を示した.
• 単細胞データは,HCCEvoSig遺伝子の異質性と,非腫瘍領域から腫瘍領域への漸進的な空間的移行を確認した.
• 高いHCCEvoSigリスクスコアは,HCCの進行と死亡リスクの増加を予測し,既存のシグネチャーを上回り,治療応答を予測しました.

結論:

• HCC腫瘍内の地域的な転写異質性は,重要な生存シグナルを含んでいます.
• 検証されたHCCEvoSigは,HCC患者のための強力な予後情報と予測的有用性を提供し,臨床意思決定を支援します.