MALDI-TOF MSの潜在的応用は,以前に誤ってStreptococcus pneumoniaeと識別された新興病原体であるStreptococcus parapneumoniaeを特定するためである

科学分野:

• 微生物学
• ゲノミクス
• 臨床診断

背景:

• 効果的な臨床管理と疫学研究のために, *Streptococcus* 種の正確な識別が不可欠です.
• *Streptococcus parapneumoniae* を *Streptococcus pneumoniae* と誤って分類すると,診断が遅れて治療戦略が最適化されない可能性があります.
• 密接に関連した *Streptococcus* 種を区別することは公衆衛生にとって不可欠です.

研究 の 目的:

• 香港の新種の *Streptococcus parapneumoniae* を特定し特徴づけること.
• これらの菌株の毒性因子と抗菌剤耐性プロフィールを調査する.
• MALDI-TOF MSを使用して,S. parapneumoniaeの迅速かつ正確な識別のための潜在的なバイオマーカーを探求する.

主な方法:

• 種別PCRを用いて,アーカイブされた *Streptococcus pneumoniae* 単離体を *S. parapneumoniae* の検診を行った.
• 完全なゲノムシーケンシング (WGS),系統遺伝学,比較ゲノム解析を決定的な種識別と特徴付けのために実施した.
• 飛行質量スペクトロメトリ (MALDI-TOF MS) のマトリックスアシストレーザー脱吸収/イオン化時間は,潜在的なスペクトルバイオマーカーを特定するために使用されました.

主要な成果:

• 2024年に日本で確認された新種である*Streptococcus parapneumoniae*の3株が,香港で呼吸器感染症の患者から隔離されました.
• WGSはこれらの株をS. parapneumoniae (> 99% ANI) と確認し,S. pneumoniae (< 94% ANI) と区別しました.
• 単離体は,局所的な * S. pneumoniae * 菌株と異なる多剤耐性およびレボフロクサシン耐性を示し, * S. pneumoniae * に類似する毒性因子を有していた. MALDI-TOF MSはユニークなピークを特定しました (m/z 6,399と6,960).

結論:

• *S. parapneumoniae* の多剤耐性は,抗菌剤耐性の監視と *S. pneumoniae* 感染症の経験的治療に課題を投げかけている.
• 特定のMALDI-TOF MSピークは,正確で迅速な種識別のための有望な道を提供します.
• *S. parapneumoniae* の有病率は過小評価されている可能性があり,その真の分布と臨床的影響を確かめるために,拡大された監視が必要である.