サレントの多様性センター (南イタリア) の見捨てられ,不足している野菜の全ゲノム配列化とフェノタイプ化

科学分野:

• 植物遺伝学とゲノム学
• 農業と作物科学
• 園芸科学

背景:

• Cucumis melo L.は,トウモロコシ (C. melo subsp. メロヴァー 蛇のメロン (C. melo subsp. メロヴァー フレキシュアス).
• 地中海文化において歴史的に重要なキュウリメロンは,現在は主にイタリア南部のサレント地方で栽培されています.
• これらの見捨てられた作物の 遺伝的多様性を理解することは 現代の農業への保存と統合に不可欠です

研究 の 目的:

• イタリアのサレント地方のキュウリとヘビのメロンの集団を収集し特徴づけること.
• 全ゲノム再配列解析を用いて,これらの集団内の遺伝的多様性を調査する.
• 遺伝的資源を特定し,追跡し,繁殖プログラムで利用する.

主な方法:

• 13種類のキュウリ・メロンと2種類のヘビ・メロンの採集と特徴付け
• 遺伝的多様性を評価するために DNA プールの全ゲノム再配列化
• 遺伝子関係と人口構造を分析するための階層的なクラスタリング.
• ゲルムプラズマの特徴と優れた集団の選択のためのフィールド試験.

主要な成果:

• 最も低いヘテロジゴシティは,広く栽培されているキュウリメロンの集団UBGCMC111で観察され,強力な農家の選択を示唆しています.
• UBGCMC111とUBGCMC053の遺伝子差異が確認され,後者はギリシャの遺産地域に関連しています.
• 蛇のメロンが 黄瓜のメロンの集まりで 遺伝的類似性を示しています
• 特定された固定および固有の1307のアレルは,追跡性にとって価値があり,その一部は特定の表型特性に結びついています.

結論:

• この研究は,Cucumis meloの重要な遺伝的多様性を侵食から守っています.
• ゲノムデータとフェノタイプデータは,これらの資源を農業食品システムと育種に統合するための基盤を提供します.
• 農作物の多様性の保全と利用は 将来の食糧安全保障と農業革新に不可欠です