豚サーコウイルス3の流行病学および分子遡及分析
Molly Kroeger1, Christopher James Stott2, Huigang Shen1
1Veterinary Diagnostic Laboratory, Veterinary Diagnostic and Production Animal Medicine, Iowa State University, IA, USA.
まとめ
豚サーコウイルス3型 (PCV3) は2016年以前に米国豚群で流行しており,その流行率は時間とともに低下している. PCV3 / PCV2の共感染率は,PCV2のワクチン導入後に著しく減少した.
科学分野:
- 獣医ウイルス学
- 豚病の疫学
- 分子 進化
背景:
- 豚サーコウイルス3型 (PCV3) は,生殖機能不全や炎症などの重大な豚の健康問題と関連しています.
- PCV3とPCV2の共感染は一般的ですが,その流行と進化の動態は2016年以前の米国豚産業では知られませんでした.
研究 の 目的:
- 2000年から2012年にかけての米国豚産業におけるPCV3およびPCV3/PCV2共感染の農場感染率と地理的分布を決定する.
- PCV3の進化速度と選択圧力を評価する.
- PCV3 カップタンパク質の構造的変化を特定する
主な方法:
- 米国の生産者完成農場からの血清サンプルを遡及的に分析 (2000年,2006年,2012年)
- PCV3単離体の全ゲノムとORF2のシーケンシング
- カップタンパク質の遺伝子解析と分子モデリング.
主要な成果:
- PCV3は2016年以前に米国豚群で流行しており,農場での流行率は2000年の47%から2012年の22%に減少した.
- PCV3/PCV2共感染率は2000年の47%から2012年の3%に低下し,PCV2ワクチンの導入と一致しました.
- 分析により複数のPCV3サブタイプ (PCV3a,PCV3b,PCV3c) が特定され,構造的変化が観察されたCapタンパク質に対する多様性の選択圧力が検出されました.
結論:
- PCV3は公式に特定されるまで10年以上アメリカ豚群で循環していた.
- PCV2ワクチン接種戦略の実施は,PCV3/PCV2共感染率を大幅に低下させたようです.
- PCV3の進行中の分子進化は,特にCapタンパク質において,ウイルスの適応と病原性に影響を及ぼす可能性があります.
