オーラルリチェン・プラヌスのlncRNA/circRNAs-miRNA-mRNAネットワークの総合的な分析

科学分野:

• 分子生物学
• ゲノミクス
• 免疫学

背景:

• 口腔平 (OLP) はT細胞媒介の炎症性口腔粘膜疾患で,分子メカニズムはよくわかっていない.
• OLPの病原性を理解し,標的型治療法を開発するために,重要な分子プレーヤーを特定することが重要です.

研究 の 目的:

• OLPに関連するハブ遺伝子を統合されたトランスクリプトミックとプロテオミックデータを使用してスクリーニングする.
• 病気のメカニズムを解明するために,競合する内生RNA (ceRNA) ネットワークを構築する.
• OLPで特定されたハブ遺伝子の診断可能性を評価する.

主な方法:

• OLP患者と健康な対照群からのトランスクリプトミックの統合分析.
• 差異的遺伝子発現分析,タンパク質とタンパク質の相互作用ネットワーク構築,加重遺伝子共発現ネットワーク分析.
• ハブ遺伝子の識別,ceRNAネットワークの構築,qPCRの検証

主要な成果:

• 103の差異的に発現する遺伝子 (DEGs) が識別され,抗原の処理とプレゼンテーションのような経路で強化されました.
• COTL1,OAS2,HLA- A,およびHLA- DPA1は,診断効果のあるハブ遺伝子として特定されました (AUC > 0. 7).
• LncRNA MIR155HG,hsa- miR-1233-5p,COTL1,OAS2を含むceRNAネットワークが構築され,検証されました.

結論:

• 統合されたマルチオミクスデータは OLPの重要な分子メカニズムを明らかにします.
• 特定されたハブ遺伝子とceRNAネットワークは,OLPの潜在的な診断バイオマーカーと治療標的を提供します.
• circRNA/lncRNA-miRNA-mRNAネットワークに関するさらなる研究は,OLPの理解と治療を進める可能性があります.