慢性アピカル歯周炎におけるクプロプトーシス関連遺伝子の特定 バルクおよび単細胞RNA配列解析および実験的検証

科学分野:

• 口腔生物学
• 細胞 死 の 経路
• ゲノミクス

背景:

• 慢性アピカル歯周炎 (CAP) は,根底にあるメカニズムが不明な一般的な口腔炎症です.
• 新しい細胞死経路であるクプロプトーシスは,CAPの発達の潜在的な要因である.

研究 の 目的:

• CAPに関連するクプロプトーシス関連遺伝子 (CRG) を特定する.
• CAP内の細胞相互作用におけるCRGの役割を調査する.
• CAPにおけるCRGの診断の可能性を評価する.

主な方法:

• 統合遺伝子発現オムニバス (GEO) のデータセットは,CAPと健康な対照群 (HC) のデータセットである.
• 単細胞RNA配列解析 (scRNA-seq) データを分析して,細胞群の変異を評価した.
• 利用された受容器操作特性 (ROC) 曲線,qRT-PCR,および免疫ヒスト化学 (IHC) を検証した.

主要な成果:

• CAPで差異的に表現された8つのCRG (DE-CRG) を特定した.
• CAP 線維芽細胞とマクロファージの 細胞間通信に関する 重要な変化を発見した.
• qRT-PCRとIHCによるCAP組織におけるDE-CRGの発現が確認され,強力な診断の可能性を示した.

結論:

• CRGはCAPの病原性に関与している.
• CRGを含むCOL4A1- ファイブロブラストとAPOE- マクロファージの相互作用は,CAPにおけるクプロプトーシスを促進する可能性があります.
• CRGはCAPの潜在的な診断バイオマーカーです.