pMHC偽型ウイルスと酵母ディスプレイを用いたTCR抗原インターフェースの深層マッピング

科学分野:

• 免疫学
• 分子生物学
• バイオテクノロジー

背景:

• T細胞受容体 (TCR) の特異性は,効果的なT細胞療法にとって極めて重要です.
• TCR-抗原の相互作用をマッピングする現在の方法は,スケーラビリティがない.
• TCR 配列-機能関係を理解することは,治療開発に不可欠です.

研究 の 目的:

• 多様な抗原に対するTCR特異性をマッピングするためのスケーラブルな方法を開発する.
• 特にCDR3ループにおけるTCR配列の変異が抗原認識にどのように影響するかを調査する.
• エンジニアリングと予測モデリングのためのTCR-抗原相互作用の深い,高通量データを生成する.

主な方法:

• VelociRAPTRの導入 図書館間でのスクリーニングアプローチ
• イーストディスプレイのTCRライブラリとペプチドMHCディスプレイのウイルスのような粒子 (pMHC-VLP) を使用する.
• CDR3ループとペプチドの変異を含む複数のpMHCに対する何百万人ものTCR変異体の同時スクリーニング.

主要な成果:

• pMHC- VLPは酵母で示されたTCRに効果的に結合し,再結合のpMHCタンパク質と比べられるデータを得ました.
• VelociRAPTRは92のpMHCに対する4700万のTCR変異を成功裏にスクリーニングしました.
• 詳細なCDR3-pMHCマップが生成され,CDR3ループ変異が特異性を調節し,選択的制約または認識の拡大を可能にします.

結論:

• VelociRAPTRは,高通量タンパク質相互作用のマッピングのための一般化可能な戦略を提供します.
• 作成されたマップは,パーソナライズされたpMHC結合プロファイルを持つTCRを設計するための洞察を提供します.
• このアプローチは,TCR抗原相互作用とT細胞治療における標的外認識を予測するためのモデルを強化します.