関連する実験動画
Updated: Sep 9, 2025

13:14
Genetic Barcoding with Fluorescent Proteins for Multiplexed Applications
Published on: April 14, 2015
9.4K
固有の非反復性ゲノムロキの頑丈な光ラベルと追跡
bioRxiv : the preprint server for biology
|September 5, 2025
まとめ
生きたヒト細胞のゲノム領域を追跡する 新しいシステムを開発しました この方法は,クロマチンのダイナミクスを長期にわたって高解像度で可視化することができ,常に転写に関連していない遺伝子特有の運動性を明らかにします.
科学分野:
- 分子生物学
- 遺伝学
- 細胞生物学
背景:
- ゲノムの空間的組織とダイナミクスを理解することは 遺伝子調節に不可欠です
- 固定細胞の方法は静的なスナップショットを提供し,生細胞のダイナミックなプロセスへの洞察を制限します.
- 生きた細胞の特定のゲノム領域を 長期間にわたって追跡することは依然として大きな課題です
研究 の 目的:
- 活体細胞のゲノムロキーを長期追跡するための 頑丈で遺伝子コード化されたシステムを開発する.
- 特殊な空間と時間の解像度を持つ遺伝子近接領域の高精度追跡を可能にします.
- クロマチンの移動性と転写活動の相関を調査する.
主な方法:
- *Staphylococcus aureus* dCas9のフローロゲンおよび補充可能なナノボディ配列融合を使用した.
- アクセス可能な非繰り返しのゲノムロクスを標識するために,コンパクトなポリシストロニック単一ガイド (sg) RNAを使用した.
- 探査機の選択性と光安定性を特徴付け,持続的なラベリングのための多重化 sgRNA 発現を示した.
主要な成果:
- 局所的に繰り返される要素を含む染色体ダイナミクスの全ゲノム可視化を達成した.
- 高精度追跡のための非繰り返しロシの効率的かつ持続的なラベル付けを可能にします.
- 局所的な染色体動態 (20 Hz) は遺伝子特異であり,必ずしも転写に依存していないことが判明した.
結論:
- 開発されたシステムは,規制要素のダイナミクスを追跡するための多用途,最小侵襲的で,スケーラブルです.
- 遺伝子制御に関与するダイナミックなゲノム領域の多重イメージングを容易にする.
- 多様な生物学的システムと疾患の文脈に広く適用できます.
関連する概念動画
Labeling DNA Probes
8.3K
DNA probes are fragments of DNA labeled with a reporter tag to enable their detection or purification. The resulting labeled DNA probes can then hybridize to target nucleic acid sequences through complementary base-pairing, and may be used to recover or identify these regions.
Radioisotopes, fluorophores, or small molecule binding partners like biotin or digoxigenin, are the most widely used reporter tags for labeling DNA probes. These labels can be attached to the probe DNA molecule via...
Radioisotopes, fluorophores, or small molecule binding partners like biotin or digoxigenin, are the most widely used reporter tags for labeling DNA probes. These labels can be attached to the probe DNA molecule via...
8.3K
Reporter Genes
11.8K
Reporter genes are a type of protein-coding gene that are often tagged to a gene of interest. Once inside a target cell, reporter genes usually produce visually identifiable characteristics like fluorescence and luminescence when expressed along with the gene of interest. Thus, reporter genes “report” the presence or absence of genes of interest in an organism, determine the gene expression pattern, or track the physical location of a DNA segment or protein in the cell.
11.8K
Protein Dynamics in Living Cells
2.2K
Different fluorescence-based techniques are used to study the protein dynamics in living cells. These techniques include FRAP, FRET, and PET.
Fluorescent recovery after photobleaching (FRAP) is a fluorescent-protein-based detection technique used to quantify protein movement rates within the cell. This method exposes a small portion of the cell to an intense laser beam. The laser beam causes permanent photobleaching of the fluorophore-tagged proteins in the exposed region. As the bleached...
Fluorescent recovery after photobleaching (FRAP) is a fluorescent-protein-based detection technique used to quantify protein movement rates within the cell. This method exposes a small portion of the cell to an intense laser beam. The laser beam causes permanent photobleaching of the fluorophore-tagged proteins in the exposed region. As the bleached...
2.2K
FISH - Fluorescent In-situ Hybridization
21.1K
Fluorescence in situ hybridization, or FISH, was developed in the early 1980s and has quickly become one of the most widely used techniques in cytogenetics. Labeled probes are used to bind complementary DNA or RNA sequences on a chromosome or in a region within a cell. Earlier, the probes could only be obtained by cloning or reverse transcription of a DNA template. Currently, the probe oligonucleotides can be synthesized synthetically. Additionally, with the advancement of optical techniques,...
21.1K

