豚のサーコウイルス2ゲノムの自動化されたピクセルベースの定量化,フォームリン固定,パラフィン埋め込まれた組織でin situハイブリッド化

科学分野:

• 獣医学病理学
• 分子診断
• デジタル病理学

背景:

• リンパ性組織における豚サーコウイルス2 (PCV2) の検出は,疾患の診断と研究において極めて重要です.
• PCV2に対する in situ ハイブリデーション (ISH) の伝統的な視覚的評価は主観的かもしれない.
• 診断の正確さを高めるために客観的な量化方法が必要です.

研究 の 目的:

• RNAscope® ISHを使用してPCV2RNAを定量化するための自動ピクセル分類器を開発し,検証する.
• デジタル ISH 定量化と伝統的な視覚スコアを比較する.
• PCV2検出のためのデジタル ISHと定量PCR (qPCR) の相関性を評価する.

主な方法:

• RNAscope® ISH用の自動ピクセル分類器の開発
• 66匹の豚から採取した4つのリンパ組織 (桃体,気管支柱,中腸, inguinal リンパ節) の分析.
• 視覚的なISHスコア (0-3) とデジタル定量化 (%ラベルされた面積) とqPCRの比較

主要な成果:

• 視覚的およびデジタルISHスコアとの間に強い相関関係 (ρ = 0. 96) が発見されました.
• トラキオブロンキアルリンパ節 (TBLN) は,PCV2の標識が最も高かった.
• デジタル ISH の結果は,qPCR の結果と強く相関していた (ρ = 0. 85).

結論:

• 自動化されたデジタル病理学は,リンパ性組織におけるPCV2の信頼性と客観的な定量化を提供します.
• デジタルスコアリングはPCV2診断の一貫性を高め,観察者のバイアスを軽減します.
• このアプローチは,PCV2の研究,監視,疾患管理の効率を向上させます.