米国で食用動物および関連する肉製品から分離された非チフス型サルモネラにおけるクラス1およびクラス2インテグロンのゲノム構造

科学分野:

• 微生物学
• ゲノミクス
• 分子生物学

背景:

• インテグロンは,抗菌剤耐性 (AMR) を授与する遺伝子を含む遺伝子を捕捉し,発現する移動性遺伝子要素です.
• サルモネラ菌種は食品に感染する重要な病原体であり,その抗菌剤耐性は公衆衛生上の懸念が高まっています.

研究 の 目的:

• 食用動物および肉製品からのサルモネラ単離体におけるインテグロンの検出と特徴づけ
• これらのインテグロン内のゲノム構造,位置,関連遺伝子 (AMR,毒性,ストレス反応) を分析する.

主な方法:

• 食品用動物および肉製品からの193種のサルモネラ菌株の全ゲノム配列解析 (2001年−2019年)
• インテグロン存在を特定し,インテグロンを分類し,そのゲノム文脈と関連する遺伝子を特徴付けるためのバイオ情報分析.

主要な成果:

• 単離物の60. 1%がクラス1および/またはクラス2のインテグロンを持ち,クラス1のインテグロンが最も一般的であった.
• インテグロンは染色体とプラズミッド (様々なInc型にリンク) で発見され,69の異なったAMR遺伝子を携えている.
• ウイルス性およびストレス反応遺伝子 (例えば,groES-groEL) は,インテグロンカセット内で一般的に特定されました.

結論:

• クラス1のインテグロンは,食品源の多剤耐性 (MDR) サルモネラに広く存在します.
• インテグロンは抗菌剤耐性の拡散において重要な役割を果たし,サルモネラの適応と病原性を促進する.