HIV感染者における宿主内SARS-CoV-2の多様性は,SARS-CoV-2の進化軌道を洞察する
R Joseph1, G Marais2,3, I Iranzadeh1
1Division of Medical Virology, Institute of Infectious Disease and Molecular Medicine, University of Cape Town, Cape Town, South Africa.
免疫不全の個体,特にHIV感染者 (PLWH) の持続的なSARS-CoV-2感染は,ウイルスの進化と免疫脱出変異を引き起こす可能性があります. この研究は,新しい変種とVOCの出現のための貯蔵庫としての潜在的な役割を強調しています.
科学分野:
- ウイルス学 と ウイルス 進化
- 免疫不全の宿主病原性
- 感染症のゲノム監視
背景:
- 継続的な感染を有する免疫不全の個体における進行中のウイルス進化は,SARS-CoV-2の懸念される変種 (VOC) の出現を促進する可能性があります.
- 持続的なSARS-CoV-2感染頻度,進化パターン,HIV感染率が高い南アフリカにおけるウイルス多様性への貢献に関するデータは限られている.
研究 の 目的:
- 南アフリカにおける免疫不全の個体における持続的なSARS-CoV-2感染の頻度と進化パターンを調査する.
- 新しい変異を特定し 免疫脱出の可能性を評価する
- SARS-CoV-2 変種の出現における持続的な感染の役割を理解する.
主な方法:
- SARS-CoV-2の診断が少なくとも2件あった75人を対象に,少なくとも1ヶ月間隔で研究を行った.
- これらの個体から採取したサンプルで,完全なSARS-CoV-2ゲノム配列を解析した.
- ウイルス配列の変異,進化の軌跡, 潜在的免疫脱出特性を分析した.
主要な成果:
- 72例の再感染と3例の持続的なSARS-CoV-2感染が確認され,すべてHIV感染者 (PLWH) でCD4+T細胞数が30細胞/μL未満の重症免疫不全患者であった.
- Spikeタンパク質の異常な突然変異 (全般的流行率<0. 01%) と免疫脱出の可能性のある突然変異の出現が観察され,一部はOmicronのような後のVOCで発見されました.
- 縦横のウイルス配列は,SARS-CoV-2の進化軌道を洞察し,収束進化と宿主適応を示唆した.
結論:
- 重度の免疫不全のPLWHにおける持続的なSARS-CoV-2感染は,ウイルス進化の貯蔵庫として作用し,免疫回避型の発生を促す可能性があります.
- 免疫機能が低下した集団におけるゲノム監視は,SARS-CoV-2の進化を理解し,ワクチン設計に情報を提供するために重要である.
- これらの発見は,将来のSARS-CoV-2変異の影響を予測し軽減するために,免疫機能低下した個体における標的型監視の重要性を強調しています.
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