レジオネラ・ロングビッチャーのコアゲノムマルチロカス配列型化スキームの開発と検証

科学分野:

• 微生物 学 と 感染症
• ゲノム流行病学
• 公衆衛生の監視

背景:

• レジオネラ・ロングビーチは,特にオーストラリアやニュージーランドなどの地域で,レジオネラ病 (LD) の重要な原因です.
• L. longbeachaeのゲノム監視ツールは,L. pneumophilaの利用可能なツールの遅れで,アウトブレイク調査を妨げています.
• L.ロングビッチャーの正確な追跡は,その世界的な健康への影響を理解し,病気の伝播を制御するために不可欠です.

研究 の 目的:

• レジオネラ・ロングビッチャーのコアゲノム多部位配列型化 (cgMLST) スキムの開発と検証
• L. longbeachaeの発生と発生源の特定に関するゲノム監視能力を強化する.
• L. longbeachaeの感染を調査する公衆衛生研究所に強力なツールを提供すること.

主な方法:

• L. longbeachaeの7つの完全なゲノムと89のドラフトゲノムを使用したcgMLSTスキーマの開発.
• 2,608のロシを95%の存在の値で設計した.
• 192種類のL.ロングビーチイの単離体によるcgMLSTスキームの検証

主要な成果:

• L. longbeachaeの精密に定義されたcgMLSTスキーマが確立され,単離体は98%以上の標的遺伝子の存在を示した.
• cgMLSTは,コアゲノムSNP型と高い一致性を示したが,より高い解像度を提供した.
• このスキームは,配列化されたL. longbeachae単体の多様性を効果的に捕捉しました.

結論:

• 開発されたcgMLSTスキームは,L. longbeachaeの全ゲノムシーケンシングベースの監視のための強力なツールを提供します.
• この進歩は,アウトブレイクを追跡し,L.ロングビーチの世界的な流行病学を理解する能力を向上させるでしょう.
• 強化されたゲノム監視は,L. longbeachaeによって引き起こされるレギオネア病のより良い制御戦略に貢献します.