Litopenaeus vannameiのトランスクリプトミック分析:淡水環境における塩分適応メカニズムを理解する
Xuenan Li1,2,3, Xi Cheng1,2,3, Xilin Dai4,5,6
1Key Laboratory of Freshwater Aquatic Genetic Resources, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Shanghai Ocean University, Shanghai, 201306, China.
Abstract:
Litopenaeus vannameiは塩分に強い適応性を表していますが,淡水環境では生存と成長が著しく低下しています. 淡水環境に対するL. vannameiの反応メカニズムを調査するために,淡水環境と海水環境の両方で30日間培養されたの組織が実験材料として使用されました. Illuminaプラットフォームを使用してトランスクリプトーム配列を解析し,塩分ストレスに関連した差別発現遺伝子 (DEGs) と調節経路を分析した. さらに,トランスクリプトームの発見を検証するために,リアルタイムの定量PCRが使用されました. グループ間で合計1173のDEGが特定され,その中には408のアップレギュレーションと765のダウンレギュレーション遺伝子が含まれていた. これらのDEGは主にATP結合,代謝プロセス,酸化性リン酸化, purin代謝,およびファゴソーム形成に関連する経路と関連していました. Litopenaeus vannameiは,酸化性リン酸化などのエネルギー代謝経路を強化することで,度調節のエネルギー需要を増やすように見える. グルタチオンの代謝経路のアップレギュレーションは,塩分ストレスによる酸化ダメージを軽減するのに寄与する可能性があります. さらに,皮質経路の構造成分における遺伝子の濃縮は,イオン調節とオスモスのバランスの維持における役割を示唆しています. この研究は,淡水養殖条件下でL. vannameiの生理学的反応機構の理解を進めるための基礎データを提供します.
