ハプロタイプ解析したゲノムとマルチオミクス風景は,レモンの酸蓄積の表遺伝的調節を明らかにする
Yue Wang1, Yike Zeng1, Yilei Wang1
1National Key Laboratory for Germplasm Innovation & Utilization of Horticultural Crops, College of Horticulture and Forestry Science, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, PR China.
レモン酸の蓄積を理解することは 鍵です 甘いレモンとは異なり,PH5遺伝子プロモーターの低DNAメチル化が高いチート酸のレベルを誘発する.
科学分野:
- 植物ゲノム学
- シトルス生物
- 果物の生化学
背景:
- リンゴ (Citrus limon L.) は,リンゴ酸の生成に不可欠です.
- レモンの酸の蓄積のメカニズムはほとんど不明である.
研究 の 目的:
- "ユーレカ"レモンのハプロタイプ解析ゲノムを生成する.
- リン酸の代謝と蓄積を調節する遺伝的要因を特定する.
- レモンの家畜化と繁殖の可能性を理解するために
主な方法:
- ハプロタイプ解析による"ユーレカ"レモンのゲノム配列決定
- 比較ゲノミクスと遺伝子ファミリー収縮の分析
- DNAメチル化を評価するために全ゲノムビスルフィート配列
- ユーレカと甘いレモンのPH5の遺伝子発現分析
主要な成果:
- リン酸代謝に関連した 特定された家畜のロシウム
- 序列,発現,メチル化における有意なアレル変化が観察された.
- ユーレカのレモンのPH5トランスクリプトレベルが 劇的に高かったのです
- PH5プロモーターの低メチル化が高いリン酸含有量と相関していることが示された.
結論:
- PH5プロモーターの低いDNAメチル化は,レモンの高い酸蓄積に不可欠です.
- 酸性/無酸性栽培のシтруス栽培と遺伝子工学についての洞察を提供します.
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