競合する内生RNAに基づいて,パルピチスの予測のための免疫関連長い非コーディングRNAの識別

科学分野:

• 口腔生物学
• 免疫学
• バイオ情報学
• 分子生物学

背景:

• Pulpitisは,歯の健康に影響を与える一般的な炎症性口腔疾患です.
• 分子メカニズムの理解,特に免疫不調は,パルピティスの管理に不可欠です.
• 長い非コーディングRNA (lncRNAs) は,炎症性疾患における役割としてますます認識されています.

研究 の 目的:

• 生物情報学的アプローチを用いて,パルピティスの免疫関連 lncRNA を特定する.
• 競合する内生RNA (ceRNA) ネットワークを通じて,これらのlncRNAの機能的役割を解明する.
• 免疫関連 lncRNA に基づくパルピティスの潜在的な診断バイオマーカーを探求する.

主な方法:

• 患者と健康な歯のパルプのサンプルからのlncRNAの差異表現分析.
• 分類モデル開発のためのLASSO回帰
• シングルサンプルの遺伝子セット濃縮分析 (ssGSEA) とウェイトド遺伝子相関ネットワーク分析 (WGCNA) で,免疫関連のlncRNAとその機能を特定する.
• miRanda,TargetScan,およびmiRDBデータベースを使用した lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA ネットワークの構築.

主要な成果:

• 5- lncRNA分類モデルが確立され,CARD8- AS1とLINC00924が有意に免疫関連であることが確認された.
• WGCNAは,CARD8-AS1とLINC00924が免疫強化モジュールと関連していることを示した.
• CARD8-AS1中心のceRNAネットワークが構築され,JAK-STAT信号伝達のような経路に関与する免疫関連遺伝子 (PTGS2,NLRP3,CXCL3) との相互作用が強調されました.

結論:

• lncRNA CARD8- AS1とその関連 ceRNA ネットワークは,パルピチス中の免疫応答を調節する上で重要な役割を果たします.
• 免疫関連のlncRNAs,特にCARD8-AS1は,パルピティスの新しい非侵襲的診断マーカーとして潜在性を示しています.
• CARD8-AS1の調節機能に関するさらなる研究は,パルピティスの新しい治療目標を提供することができます.