Jove
Visualize
お問い合わせ
JoVE
x logofacebook logolinkedin logoyoutube logo
JoVEについて
概要リーダーシップブログJoVEヘルプセンター
著者向け
出版プロセス編集委員会範囲と方針査読よくある質問投稿
図書館員向け
推薦の声購読アクセスリソース図書館諮問委員会よくある質問
研究
JoVE JournalMethods CollectionsJoVE Encyclopedia of Experimentsアーカイブ
教育
JoVE CoreJoVE BusinessJoVE Science EducationJoVE Lab Manual教員リソースセンター教員サイト
利用規約
プライバシーポリシー
ポリシー

関連する概念動画

Gene Evolution - Fast or Slow?02:05

Gene Evolution - Fast or Slow?

7.9K
The genomes of eukaryotes are punctuated by long stretches of sequence which do not code for proteins or RNAs. Although some of these regions do contain crucial regulatory sequences, the vast majority of this DNA serves no known function. Typically, these regions of the genome are the ones in which the fastest change, in evolutionary terms, is observed, because there is typically little to no selection pressure acting on these regions to preserve their sequences.
In contrast, regions which code...
7.9K
Gene Evolution - Fast or Slow?02:05

Gene Evolution - Fast or Slow?

3.4K
3.4K
Evolutionary Relationships through Genome Comparisons02:54

Evolutionary Relationships through Genome Comparisons

6.8K
Genome comparison is one of the excellent ways to interpret the evolutionary relationships between organisms. The basic principle of genome comparison is that if two species share a common feature, it is likely encoded by the DNA sequence conserved between both species. The advent of genome sequencing technologies in the late 20th century enabled scientists to understand the concept of conservation of domains between species and helped them to deduce evolutionary relationships across diverse...
6.8K
Convergent Evolution01:54

Convergent Evolution

31.3K
Evolution shapes the features of organisms over time, ensuring that they are suited for the environments in which they live. Sometimes, selection pressure leads to the rise of similar but unrelated adaptations in organisms with no recent common ancestors, a process known as convergent evolution.
31.3K
Speciation Rates01:07

Speciation Rates

22.5K
Overview
22.5K
The Evidence for Evolution02:55

The Evidence for Evolution

47.5K
Genetic variations accumulating within populations over generations give rise to biological evolution. Evolutionary changes can result in the formation of novel varieties and entire new species. These changes are responsible for the diverse forms of life inhabiting the planet. The evidence for evolution suggests that all living organisms descended from common ancestors.
47.5K

こちらも読む

関連記事

共著者、ジャーナル、引用グラフによってこの研究に関連する記事。

並び替え
Same author

The Vertebrate Genomes Project Phase I: A global reference genome resource.

bioRxiv : the preprint server for biology·2026
Same author

RERconverge Update: Runtime Reduction and Analysis Function Overhaul.

bioRxiv : the preprint server for biology·2026
Same author

A scalable approach to investigating sequence-to-function predictions from personal genomes.

Nature methods·2026
Same author

Evaluating open LLMs for agentic analysis orchestration in a typical biomedical lab.

bioRxiv : the preprint server for biology·2026
Same author

Beyond Invariable Sites: Using Evolutionary Stasis to Map Multi-Layered Constraints on the Evolution of Viral and Mammalian Genomes.

bioRxiv : the preprint server for biology·2026
Same author

The Common Fund Data Ecosystem (CFDE).

bioRxiv : the preprint server for biology·2026

関連する実験動画

Updated: Jan 8, 2026

Using Phylogenetic Analysis to Investigate Eukaryotic Gene Origin
08:57

Using Phylogenetic Analysis to Investigate Eukaryotic Gene Origin

Published on: August 14, 2018

16.4K

MoleRate：分子相対進化速度の比較による収束進化の検出

Avery G Selberg1,2, Nathan Clark3, Anton Nekrutenko4

  • 1Institute for Genomics and Evolutionary Medicine, Temple University, Philadelphia, PA, USA.

Evolution; international journal of organic evolution
|December 12, 2025
PubMed
まとめ

MoleRateは、遺伝子の進化速度の加速または低下を特定する新しい系統学的速度テストです。このツールは、種を超えた適応と機能的重要性という分子基盤の解明に役立ち、表現型に関連する重要な選択圧を明らかにします。

キーワード:
収束進化分子進化系統比較法

さらに関連する動画

A Bioinformatics Pipeline for Investigating Molecular Evolution and Gene Expression using RNA-seq
07:09

A Bioinformatics Pipeline for Investigating Molecular Evolution and Gene Expression using RNA-seq

Published on: May 28, 2021

10.4K
A Concoction Pipeline for Generating Molecular Operational Taxonomic Units (MOTUs) Among Riparian and Aquatic Beetles
10:23

A Concoction Pipeline for Generating Molecular Operational Taxonomic Units (MOTUs) Among Riparian and Aquatic Beetles

Published on: July 11, 2025

530

関連する実験動画

Last Updated: Jan 8, 2026

Using Phylogenetic Analysis to Investigate Eukaryotic Gene Origin
08:57

Using Phylogenetic Analysis to Investigate Eukaryotic Gene Origin

Published on: August 14, 2018

16.4K
A Bioinformatics Pipeline for Investigating Molecular Evolution and Gene Expression using RNA-seq
07:09

A Bioinformatics Pipeline for Investigating Molecular Evolution and Gene Expression using RNA-seq

Published on: May 28, 2021

10.4K
A Concoction Pipeline for Generating Molecular Operational Taxonomic Units (MOTUs) Among Riparian and Aquatic Beetles
10:23

A Concoction Pipeline for Generating Molecular Operational Taxonomic Units (MOTUs) Among Riparian and Aquatic Beetles

Published on: July 11, 2025

530

科学分野:

  • 進化ゲノミクス
  • 系統学
  • 分子進化

背景:

  • 遺伝子の進化速度は、保存、機能的重要性、または適応を示すことができます。
  • 大規模なゲノムデータは、表現型に関連する進化速度シフトの研究機会を提供します。
  • 収束表現型適応は、系統間の繰り返しの速度シフトに反映される可能性があります。

研究 の 目的:

  • 進化速度シフトを検出するための新しい系統学的速度テストであるMoleRateを導入します。
  • 進化速度分析のための尤度ベースの仮説検定フレームワークを提供します。
  • 単一系統からの異常なシグナルの検出とフィルタリングを可能にします。

主な方法:

  • 明示的な系統学的速度テスト（MoleRate）を開発しました。
  • MoleRateをシミュレーションデータおよび経験的データ（哺乳類の表現型を含む）に適用しました。
  • 結果の探索とコミュニケーションのための可視化ツールを利用しました。

主要な成果:

  • MoleRateは、表現型に関連する選択圧の生物学的に有意な濃縮を検出します。
  • 特定の表現型に関連するタンパク質コード遺伝子の加速または低下した進化速度を特定しました。
  • MoleRateの既存の方法に対する優れたパフォーマンスを実証し、堅牢なシグナル検出を含みます。

結論:

  • MoleRateは、表現型進化の根底にある分子適応を特定するための効果的なツールです。
  • この方法は、特定の表現型に関連する重要な選択圧を明らかにします。
  • MoleRateは、進化ゲノミクスと適応進化の発見の研究を強化します。