Charitéオープン標準プラズマプロテオミクス（OSPP）を用いたクロスプラットフォーム臨床プロテオミクス

科学分野:

• 生化学
• プロテオミクス
• 分析化学

背景:

• 血漿および血清プロテオミクスは、疾患の特性評価、バイオマーカー同定、および診断技術の進歩にとって重要です。
• 現在のプロテオミクスワークフローでは、精度、再現性、コスト効率、およびクロスプラットフォーム転送可能性の改善が必要です。

研究 の 目的:

• 質量分析ベースの血漿および血清プロテオミクスのためのオープンで汎用性の高いペプチド内部標準を開発すること。
• プロテオミクス解析の精度、再現性、およびクロスプラットフォーム互換性を向上させること。

主な方法:

• 211個の濃度マッチング安定同位体標識ペプチドを使用したCharitéオープンペプチド標準プラズマプロテオミクス（OSPP）の生成。
• 複数のLC-MSプラットフォームを使用した血清およびさまざまな血漿タイプ（EDTA、クエン酸塩、ヘパリン）におけるOSPP定量化の検証。
• COVID-19コホート研究におけるOSPPの有用性の実証。

主要な成果:

• OSPPペプチドは、異なるサンプルタイプとLC-MSプラットフォーム間で一貫して定量されました。
• OSPPペプチドは、多様な生物学的プロセス、臨床検査、および薬剤標的タンパク質を表しており、臨床マーカーパネルとしての使用を可能にします。
• OSPPは、分析性能を向上させ、クロスプラットフォームデータアラインメントを容易にし、COVID-19研究における疾患層別化とバイオマーカー発見を支援しました。

結論:

• OSPPは、血漿および血清プロテオミクスを強化するための価値のあるオープンアクセスツールです。
• OSPPは、分析性能を向上させ、クロスプラットフォームデータハーモナイゼーションを可能にします。
• OSPPは、COVID-19などの感染症を含む疾患研究におけるバイオマーカー発見と臨床応用を促進します。