分類学的に曖昧な臨床コリネバクテリウム分離株のゲノムおよび表現型の多様性

科学分野:

• 微生物学; ゲノミクス; 感染症

背景:

• コリネバクテリウム細菌はヒトの皮膚に一般的ですが、感染症を引き起こす可能性があります。; 多様な患者の感染症から56の分離株が分析されました。; 質量分析法による初期同定は、種レベルの割り当てには不十分でした。

研究 の 目的:

• 全ゲノムシーケンシングを使用して、臨床分離株からコリネバクテリウム種を正確に同定すること。; これらの種内のゲノムおよび表現型の変動を特徴づけること。; 臨床コリネバクテリウム分離株における抗菌薬耐性パターンを評価すること。

主な方法:

• 56の分離株に対して全ゲノムシーケンシングが実施されました。; 種同定には、デジタルDNA-DNAハイブリダイゼーション、系統ゲノムツリー配置、および平均塩基配列同一性（ANI）が使用されました。; 34株のサブセットが生物化学的特徴づけおよび抗菌薬感受性試験（AST）を受けました。

主要な成果:

• 13の分離株が曖昧な種割り当て（ANI < 95%）を示し、28の異なるコリネバクテリウム種が同定されました。; 2つの分離株は潜在的に新規種（ANI < 90%）を表します。; 広範な抗菌薬耐性（AMR）が観察され、特にクリンダマイシン耐性（64.7%）は獲得耐性遺伝子と関連していました。

結論:

• 本研究は、臨床的に関連のあるコリネバクテリウム種に関する理解を深め、著しいゲノムおよび表現型の多様性を強調しています。; 現在の種定義は、観察された変動のために改訂が必要になる場合があります。; 高レベルのAMRは感染症治療を複雑にする可能性がありますが、これらの分離株の病原性については依然として不確かです。