非意図的なフラグメントとそのダークメタボローム、非標的プロファイリング、分子ネットワーキング、公開データ、およびリポジトリ規模分析への影響に関する展望

科学分野:

• 分析化学
• メタボロミクス
• 質量分析

背景:

• イン/ポストソースフラグメント（ISF）は、質量分析中に形成されるイオンであり、非標的メタボロミクスにおけるデータ解釈を複雑にします。
• ISFが「ダークマター」（アノテーションされていないスペクトル）および「ダークメタボローム」（アノテーションされていない分子）に果たす役割は議論されており、メタボライトアノテーションと発見に影響を与えます。

研究 の 目的:

• 「ダークメタボローム」の定義を洗練することを提案する。
• ISFおよび関連イオン種（付加体、マルチマー）の体系的な概要を提供する。
• ISFがメタボロミクスワークフローとデータマイニングに与える影響を調査する。

主な方法:

• 質量分析におけるISFの文献レビューと概念分析。
• ISF、付加体、およびマルチマーの体系的な概要。
• メタボライトアノテーション、実験設計、統計分析、および計算ワークフローに対するISFの影響の調査。

主要な成果:

• ISFは、メタボライトアノテーションの精度と非標的メタボロミクスデータの解釈に大きく影響します。
• 既存の定義とワークフローでは、ISFを適切に考慮していない可能性があり、誤解を招く可能性があります。
• ISFの洗練された理解と体系的な処理は、メタボロミクス研究を進歩させるために不可欠です。

結論:

• 「ダークメタボローム」の定義を洗練し、ISFを理解することは、厳密なメタボロミクスに不可欠です。
• ISF関連の課題を軽減するための研究者およびレビュー担当者向けの実際的な推奨事項が提供されます。
• ISFに対処することで、未知の分子空間を探索し、新たな発見を解き明かす分野の能力が向上します。