SARS-CoV-2 Eタンパク質とZO-1 PDZ2の相互作用を標的とするHTRFベースの小分子同定

科学分野:

• ウイルス学
• 構造生物学
• 創薬

背景:

• SARS-CoV-2 Eタンパク質は、ウイルスの病原性に関与するZO-1などの宿主タンパク質と相互作用する。
• Eタンパク質のPDZ結合モチーフ（PBM）相互作用を標的とすることは、潜在的な治療戦略である。

研究 の 目的:

• Eタンパク質PBMとZO-1 PDZ2の相互作用の構造基盤を解明すること。
• 抗ウイルス開発のためにこの相互作用を阻害する小分子を同定すること。

主な方法:

• 複合体の構造を決定するためのX線結晶学。
• 化合物ライブラリの均一時間分解蛍光（HTRF）スクリーニング。
• 細胞毒性アッセイ、用量反応研究、ドッキングシミュレーション、および抗ウイルスアッセイ。

主要な成果:

• X線構造解析により、E PBMペプチドによって結合されたZO-1 PDZ2のドメインスワップ二量体が明らかになった。
• HTRFスクリーニングにより36個の相互作用阻害化合物が同定され、さらにアッセイを行った結果14個が有望視された。
• 化合物は、競合的結合またはZO-1二量体化の防止によって相互作用を阻害した。
• 1つの化合物、C19は、抗ウイルスアッセイにおいてSARS-CoV-2複製を有意に減少させた。

結論:

• SARS-CoV-2 Eタンパク質/ZO-1 PDZ2相互作用は、直接的または間接的なメカニズムによって小分子によって阻害され得る。
• 化合物C19は、この相互作用を標的とする抗ウイルス治療候補としての可能性を示した。