クマのDNAメチル化に基づく低侵襲年齢推定
Shiori Nakamura1, Jumpei Yamazaki1,2, Naoya Matsumoto3
1Faculty of Veterinary Medicine, Hokkaido University, Kita-18, Nishi-9, Kita-ku, Sapporo, 060-0818, Hokkaido, Japan.
Scientific reports
|December 30, 2025
まとめ
研究者らは、毛髪中のDNAメチル化レベルを利用してヒグマの年齢を推定する、新しく非侵襲的な方法を開発した。この画期的な技術により、野生個体群からのサンプル収集が簡素化され、野生生物の保全と管理が向上する。
科学分野:
- 野生生物学
- 遺伝学
- 保全科学
背景:
- 年代順の年齢は、野生生物のライフヒストリー、保全、および管理にとって極めて重要である。
- DNAメチル化法は、クマにおける従来の歯ベースの年齢推定法に代わる選択肢を提供する。
- 現在のDNAメチル化法では血液または皮膚が必要であり、サンプルは捕獲された、または死亡した個体に限定される。
研究 の 目的:
- ヒグマにおけるDNAメチル化を用いた毛髪ベースの年齢推定モデルを初めて確立すること。
- 野生のヒグマ個体群における低侵襲的な年齢評価を可能にすること。
- 将来の生態学的研究および保全活動を促進すること。
主な方法:
- ビスルファイトパイロシークエンシングを用いて、ヒグマの毛根からDNAメチル化レベルを収集・分析した。
- VGF、KCNK12、およびELOVL2遺伝子近傍の年齢と相関するシトシン-リン酸-グアニン（CpG）サイトを同定した。
- 最も有意なCpGサイトを用いて年齢推定モデルを開発・検証した。
主要な成果:
- VGFおよびKCNK12遺伝子に隣接する特定のCpGサイトのDNAメチル化レベルが、年代順の年齢と相関していた。
- 最適な年齢推定モデルは、平均絶対誤差3.2年、中央値絶対誤差2.2年を達成した。
- このモデルは、2つの遺伝子（VGFおよびKCNK12）由来の3つのCpGサイトを利用した。
結論:
- 毛髪DNAメチル化からのヒグマの年齢を推定するための、新規で非侵襲的な方法が成功裏に開発された。
- この毛髪ベースの方法はサンプル収集を簡素化し、クマの捕獲の必要性をなくす。
- この技術の広範な応用は、野生クマ個体群構造の理解を大幅に改善し、保全と管理に役立つ。
