REFLEX：T細胞レパトアの大規模スケーラブルな単一細胞マルチオミクスプロファイリング

科学分野:

• 免疫学
• ゲノミクス
• バイオインフォマティクス

背景:

• T細胞の不均一性を理解することは、免疫応答の分析にとって重要です。
• 現在の単一細胞技術は、複雑な免疫レパトア研究のスループットが不足しています。

研究 の 目的:

• 新規でスケーラブル、かつコスト効率の高い単一細胞法であるREFLEXを導入すること。
• ペアになったT細胞受容体（TCR）シーケンシングによるハイスループットマルチオミクスプロファイリングを可能にすること。

主な方法:

• REFLEXは、インサイチュ逆転写とサンプルマルチプレキシングバーコードを統合しています。
• 強化されたデータキャプチャのために10x FLEXプラットフォームとシームレスに統合されています。
• プロファイリングには、CMVペプチドパルスT細胞増殖から得られた200万個以上の細胞が含まれていました。

主要な成果:

• 140万個のT細胞からTCRシーケンスとマルチオミクスデータを正常に取得しました。
• 多数の潜在的な新規CMV反応性クロノタイプを特定しました。
• T細胞レパトア分析において前例のない規模と深さを示しました。

結論:

• REFLEXは、単一細胞免疫プロファイリングの規模と深さを大幅に向上させます。
• この方法は、T細胞媒介適応免疫に関する変革的な洞察を提供します。
• REFLEXは、抗原特異的T細胞応答の発見を促進します。