非モデル作物におけるDAP-seq実験実施のための標準化プロトコルとバイオインフォマティクスパイプライン
Chen Zhang1, Chiara Foresti2, Luis Orduña1
1Institute for Integrative Systems Biology (I2SysBio), Universitat de València-CSIC, Paterna, Valencia, Spain.
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
|January 10, 2026
まとめ
DNAアフィニティ精製シーケンス(DAP-seq)は、作物の転写因子結合部位をマッピングし、作物改良を支援する。この方法は、遺伝子調節と細胞機能に関する洞察を提供し、農業形質を向上させる。
背景:
- シストロームは、調節ゲノム座を含み、細胞のアイデンティティと機能に不可欠である。
- シストロームデータを理解することは、植物の成長、発達、環境応答における分子メカニズムを明らかにする。
- 転写因子結合部位の同定は、遺伝子調節ネットワークの解明と作物形質の改善の鍵となる。
結論:
- DAP-seqは、作物生物学と遺伝子調節領域を解明するための強力なツールである。
- 標準化されたDAP-seqプロトコルと分析パイプラインは、作物種におけるスケーラビリティと効率を向上させる。
- このアプローチは、果実の品質やストレス耐性を含む作物改良の標的を特定するのに役立つ。


