イスラエルにおける入院患者のエンテロウイルス疫学（2016-2024）：中枢神経系への関与、サブタイプの多様性、季節性

科学分野:

• ウイルス学
• 疫学
• 公衆衛生

背景:

• エンテロウイルス（EV）は、軽度の発熱性疾患から重度の神経学的合併症まで、さまざまな疾患を引き起こす重要なヒト病原体である。
• EVの分子疫学、臨床的影響、季節性を理解することは、効果的な公衆衛生サーベイランスと介入戦略にとって極めて重要である。

研究 の 目的:

• イスラエルにおける入院患者のエンテロウイルス（EV）の分子疫学、臨床的影響、季節性を評価する。
• 一般的なEV遺伝子型を特定し、季節パターンを追跡し、SARS-CoV-2パンデミックがEV循環に与える影響を評価する。
• 一般的なEVサブタイプのゲノム変異とその疾患重症度、特に乳児との関連を分析する。

主な方法:

• 2016年から2024年の間にイスラエルの病院に入院した患者から採取された11,246の脳脊髄液（CSF）および5,744の便検体の後ろ向き分析。
• EV RNA検出のためのリアルタイム逆転写ポリメラーゼ連鎖反応（RT-PCR）。
• EV遺伝子型同定および系統解析のための部分VP1遺伝子シーケンシング。

主要な成果:

• CSF検体の7.1%、便検体の19.3%でEV RNAが検出された。
• CSFで最も一般的なサブタイプは、E-18、E-5、E-6、E-30、CVB5、E-4、CVB2であった。
• 季節分析により、予想される夏のピークに加え、予想外のオフシーズンのアウトブレイク、およびSARS-CoV-2パンデミック中のEV陽性率の有意な低下とその後の再興が明らかになった。
• 系統解析により、CVB2、E-5、E-6、E-18、E-30のゲノムシフトが示唆された。
• エンテロウイルスB（CVB2）感染は乳児の重症疾患と関連しており、シーケンス解析された症例の10.6%が入院治療室での管理を必要とした。

結論:

• イスラエルにおけるエンテロウイルス疫学は、季節性や遺伝子型分布の変化を含む動的な変化を示している。
• SARS-CoV-2パンデミックはEV循環パターンに大きな影響を与えたため、継続的な分子サーベイランスが必要である。
• 新たなEV株の特定と疫学トレンドの理解は、公衆衛生の準備と対応にとって不可欠である。