Jove
Visualize
お問い合わせ
JoVE
x logofacebook logolinkedin logoyoutube logo
JoVEについて
概要リーダーシップブログJoVEヘルプセンター
著者向け
出版プロセス編集委員会範囲と方針査読よくある質問投稿
図書館員向け
推薦の声購読アクセスリソース図書館諮問委員会よくある質問
研究
JoVE JournalMethods CollectionsJoVE Encyclopedia of Experimentsアーカイブ
教育
JoVE CoreJoVE BusinessJoVE Science EducationJoVE Lab Manual教員リソースセンター教員サイト
利用規約
プライバシーポリシー
ポリシー

関連する概念動画

Genome-wide Association Studies-GWAS01:11

Genome-wide Association Studies-GWAS

15.3K
Genome-wide association studies or GWAS are used to identify whether common SNPs are associated with certain diseases. Suppose specific SNPs are more frequently observed in individuals with a particular disease than those without the disease. In that case, those SNPs are said to be associated with the disease. Chi-square analysis is performed to check the probability of the allele likely to be associated with the disease.
GWAS does not require the identification of the target gene involved in...
15.3K

こちらも読む

関連記事

共著者、ジャーナル、引用グラフによってこの研究に関連する記事。

並び替え
Same author

Non-canonical role of Ku80 stabilizes Rab7A to enhance mitolysosome formation and chemotherapy in liver cancer.

Communications biology·2026
Same author

MA-DyRoLT: multi-agent path finding method based on dynamic waypoints and learning communication topology.

Scientific reports·2026
Same author

Quality, reliability, and engagement of COPD-related videos on Chinese short-form video platforms: a cross-sectional content analysis.

Scientific reports·2026
Same author

Learning to Super-Resolve Face Images via Dual-Domain Multi-scale Feature Interaction.

IEEE transactions on image processing : a publication of the IEEE Signal Processing Society·2026
Same author

Evaluating the accuracy of sex estimation from human tooth volume: leveraging automated AI segmentation and comparative analysis of machine learning algorithms.

Head & face medicine·2026
Same author

Fatigue Failure Mechanism and Crack Growth Behavior of Ti-6Al-4V ELI Titanium Alloy Welded Joints.

Materials (Basel, Switzerland)·2026
Same journal

Research hotspots and trend analyses of maximum biosafety level pathogens: A bibliometric study using China's 2023 catalogue of pathogens as an example.

Biosafety and health·2026
Same journal

Building internationally competitive journals for science data sharing: The evolution of three biomedical English academic journals launched in China.

Biosafety and health·2026
Same journal

Genomic phylogenetic characterization of <i>Brucella abortus</i> biovar 1 from a human case in Yunnan Province, China.

Biosafety and health·2026
Same journal

Establishment and application of a rapid and visual detection method for <i>Mycoplasma pneumoniae</i> using enzymatic recombinase amplification combined with lateral flow dipstick.

Biosafety and health·2026
Same journal

A semi-quantitative risk assessment of pathogenic microorganism laboratories in Beijing's CDCs based on a three-dimensional risk matrix model.

Biosafety and health·2026
Same journal

Cellular miR-24-3p inhibits vaccinia virus replication by targeting kinesin-like protein KIF21B.

Biosafety and health·2026
関連記事をすべて見る

関連する実験動画

Updated: Jan 18, 2026

Hi-C: A Method to Study the Three-dimensional Architecture of Genomes.
22:27

Hi-C: A Method to Study the Three-dimensional Architecture of Genomes.

Published on: May 6, 2010

411.5K

TempSnap-Trace: ハプロタイプネットワークトレーシングのための時間的スナップショットベースのフレームワーク

Jiajun Liu1,2, Decheng Li1,2, Yixue Li1,2,3,4,5

  • 1Department of Artificial Intelligence and Digital Health, CAS Engineering Laboratory for Nutrition, Shanghai Institute of Nutrition and Health, University of Chinese Academy of Sciences, Chinese Academy of Sciences, Shanghai 200031, China.

Biosafety and health
|January 16, 2026
PubMed
まとめ
この要約は機械生成です。

TempSnap-Traceは、ゲノムデータを分析し、系統ネットワークを推測することにより、ウイルスの進化を追跡する新しい計算フレームワークです。大規模なウイルスサーベイランスおよびバリアントトレーシングにおいて、大幅な速度とスケーラビリティの向上を提供します。

キーワード:
コミュニティ検出進化経路ハプロタイプネットワークMpox重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2 (SARS-CoV-2)

さらに関連する動画

Heuristic Mining of Hierarchical Genotypes and Accessory Genome Loci in Bacterial Populations
08:03

Heuristic Mining of Hierarchical Genotypes and Accessory Genome Loci in Bacterial Populations

Published on: December 7, 2021

2.7K
Author Spotlight: An Integrated Workflow to Study the Promoter-Centric Spatio-Temporal Genome Architecture in Scarce Cell Populations
11:36

Author Spotlight: An Integrated Workflow to Study the Promoter-Centric Spatio-Temporal Genome Architecture in Scarce Cell Populations

Published on: April 21, 2023

3.0K

関連する実験動画

Last Updated: Jan 18, 2026

Hi-C: A Method to Study the Three-dimensional Architecture of Genomes.
22:27

Hi-C: A Method to Study the Three-dimensional Architecture of Genomes.

Published on: May 6, 2010

411.5K
Heuristic Mining of Hierarchical Genotypes and Accessory Genome Loci in Bacterial Populations
08:03

Heuristic Mining of Hierarchical Genotypes and Accessory Genome Loci in Bacterial Populations

Published on: December 7, 2021

2.7K
Author Spotlight: An Integrated Workflow to Study the Promoter-Centric Spatio-Temporal Genome Architecture in Scarce Cell Populations
11:36

Author Spotlight: An Integrated Workflow to Study the Promoter-Centric Spatio-Temporal Genome Architecture in Scarce Cell Populations

Published on: April 21, 2023

3.0K

科学分野:

  • ウイルス学
  • 計算生物学
  • ゲノム科学

背景:

  • 大規模なウイルスの進化史の追跡は、重大な計算上の課題を提示します。
  • 既存の方法は、ウイルスゲノムデータの規模と複雑性に苦労する可能性があります。

研究 の 目的:

  • 大規模なウイルスの進化史を追跡するための新しい計算フレームワークであるTempSnap-Traceを導入します。
  • ウイルスサーベイランスおよびバリアント起源追跡機能を強化します。

主な方法:

  • ゲノムデータからバリアント特徴ハプロタイプ文字列を生成します。
  • 系統推論のために最小コスト全域木ネットワーク（McAN）アルゴリズムを採用します。
  • 重み付き時間的スナップショットネットワークを構築し、コミュニティ検出を通じてコア進化ノードを特定します。

主要な成果:

  • 重みなしグラフ法と比較して、モジュラリティが17.4%向上し、コード長が30.1%短縮されました。
  • SARS-CoV-2およびMpoxバリアントを正常に追跡し、感染ハブを特定し、VENASよりも27倍高速化を達成しました。VENASはメモリ制限のため処理できなかったデータを処理しました。

結論:

  • TempSnap-Traceは、大規模なウイルスサーベイランスにおいて計算効率が高く、スケーラブルです。
  • このフレームワークは、国境を越えた感染警告およびバリアント起源追跡に明確な利点を提供します。
  • SARS-CoV-2およびMpoxで有用性が検証され、堅牢な進化経路再構築を示しました。