複数の感受性エンハンサーバリアントがADD3発現を増加させ、胆道閉鎖症リスクを誘発する

科学分野:

• 遺伝学
• 発生生物学
• 肝臓病学

背景:

• 非症候群性胆道閉鎖症（BA）は、不明瞭な遺伝的基盤を持つ複雑な肝疾患である。
• 以前の研究では、ADD3座位付近、特にアジアの集団において154個のBA関連一塩基多型（SNP）が同定されたが、原因バリアントは不明のままである。

研究 の 目的:

• 154個のBA関連SNP内の原因バリアントを特定すること。
• ADD3の調節不全が肝胆道発生とBAの病原性に果たす役割を機能的に特徴づけること。

主な方法:

• 154個のBA関連SNPの調節ポテンシャルのバイオインフォマティクス予測。
• シス調節要素（CRE）のエンハンサー活性を評価するためのデュアルルシフェラーゼレポーターアッセイを用いた機能的検証。
• mRNA過剰発現とモルホリノノックダウンを介した肝胆道発生におけるADD3オルソログ（add3a）の役割を調査するためのゼブラフィッシュモデル。

主要な成果:

• 154個のSNPのうち28個が、エンハンサー機能を持つ10個の推定CREに位置していた。8個はin vitroで有意なエンハンサー活性を示した。
• 3つの座位のリスクハプロタイプは、非リスクハプロタイプと比較して有意に高いエンハンサー活性を示した。
• ゼブラフィッシュのadd3a発現は、発生中の肝臓で観察された。その摂動は胆嚢の異常と胆管密度の低下を引き起こし、BAを模倣した。

結論:

• エンハンサー内の複数のリスクバリアントがADD3発現をアップレギュレートし、胆道閉鎖症の病原性に寄与する。
• ADD3のアップレギュレーションを駆動する遺伝的バリアントは、BAの発症に関与している。