The Compartment and Variety Effects Jointly Shape Pummelo Endophytic Mycobiota

科学分野:

• 植物病理学
• マイクロバイオーム研究
• 農業科学

背景:

• 植物のマイクロバイオームは、植物の健康、成長、および抵抗性にとって重要である。
• 多くの作物において、植物マイクロバイオーム、特に内部菌類（fungal endophytes）の集合に影響を与える要因は十分に理解されていない。
• ザボン（Citrus maxima）は重要な農作物であるが、その内部菌類叢（endophytic mycobiota）は十分に研究されていない。

研究 の 目的:

• 5つのザボン（pummelo）品種の葉、根、および ризосфера 土壌における内部菌類叢（endophytic mycobiota）をプロファイリングすること。
• 植物の品種と植物の区画が菌類群集の構造と多様性に与える影響を調査すること。
• ザボン（pummelo）の品種と植物の部分によって影響を受ける特定の菌類とその分布パターンを同定すること。

主な方法:

• 菌類の内部転写スペーサー（ITS）領域のアンプリコンシーケンシングを用いた。
• サンプルには、5つの異なるザボン（pummelo）品種の葉の内部菌類、根の内部菌類、および ризосфера 土壌が含まれた。
• バイオインフォマティクス解析を用いて、菌類の豊かさ、多様性、および群集組成を評価した。

主要な成果:

• 菌類の豊かさと多様性は、植物の区画（葉、根、土壌）間で有意に異なったが、ザボン（pummelo）の品種間では差がなかった。; 内部菌類叢（endophytic mycobiota）の組成と構造は、5つのザボン（pummelo）品種間で有意に異なり、品種の効果を示唆していた。; 植物の品種は、根の内部菌類叢よりも葉の内部菌類叢に対してより強い影響を与え、Fusarium属やZasmidium属などの特定の菌類が葉において品種特異的な優占を示した。

結論:

• 植物の品種と植物の区画の両方が、ザボン（pummelo）の内部菌類叢（endophytic mycobiota）を有意に、かつ相互作用的に形成している。
• 菌類群集に対する区画の効果は品種の効果よりも強かったが、品種も重要な役割を果たしている。
• 根におけるExophiala属菌の増加のような一貫した変化が品種間で観察され、さらなる研究の潜在的なターゲットを示唆している。