鶏由来のレンサ球菌属菌株の表現型および遺伝子型分析の比較

科学分野:

• 獣医微生物学
• 薬剤耐性
• ゲノミクス

背景:

• レンサ球菌属は、家禽における重要な人獣共通感染症病原体です。
• 鳥類レンサ球菌属における薬剤耐性（AMR）の動態に関する理解は限られています。
• 亜治療量の抗菌薬の使用により、家禽分離株は十分に特徴付けられていない耐性遺伝子を保持している可能性があります。

研究 の 目的:

• 鶏由来のレンサ球菌属の表現型および遺伝子型薬剤耐性プロファイルを調査すること。
• 鳥類分離株におけるAMR決定因子および移動性遺伝要素を特定すること。
• 鶏由来レンサ球菌属株間の系統関係を評価すること。

主な方法:

• 18種類の薬剤に対する38株のレンサ球菌属株の表現型薬剤感受性試験（CLSIガイドラインに基づくブロス微量希釈法）。
• 19株の耐性株の全ゲノムシーケンシング。
• de novoアセンブリ、遺伝子アノテーション、移動性要素検出、系統ゲノム推論を含むバイオインフォマティクス解析。

主要な成果:

• 全ての分離株は、ベータラクタム系および第三世代セファロスポリン系薬剤に対して感受性を示しました。
• 最も頻繁に観察された耐性は、テトラサイクリン系（10.5%）およびフロルフェニコール（5.3%）でした。
• ゲノム解析により、テトラサイクリン耐性遺伝子（tetM、tetT）およびエリスロマイシン耐性遺伝子（erm(47)）が移動性要素に関連していることが特定されました。また、1つの株では新規のermC含有ゲノムアイランドが発見されました。

結論:

• 鶏関連レンサ球菌属において、移動性薬剤耐性決定因子が出現しています。
• 水平遺伝子伝達は、染色体への組み込みがあっても、耐性発達に寄与している可能性が高いです。
• ゲノムの均一性は、クローン性拡大を示唆しており、人獣共通感染症伝播を軽減するための標的化された鶏AMRサーベイランスの必要性を強調しています。