TAp73およびDNp73の統合的マルチモーダルプロファイリングにより、がんプログラムにおけるアイソフォーム特異的な転写調節因子ランドスケープが明らかに

科学分野:

• がん生物学
• 分子腫瘍学
• エピジェネティクス

背景:

• p73転写因子（TF）は、がん進行において相反する役割を持つ多様なアイソフォームを示す。
• DNp73はがん幹細胞性と転移を促進する一方、腫瘍抑制性のTAp73アイソフォームは、逆説的にがんの増殖を促進する可能性がある。
• 同一のDNA結合ドメインを持つp73アイソフォームがどのように異なる機能的結果をもたらすかを理解することは極めて重要である。

主な方法:

• メラノーマ細胞におけるTAp73αおよびDNp73βのゲノムワイドDNA結合をプロファイリングするためにCUT&RUNアッセイを利用した。
• coTF同定のためにJASPARデータベース、トランスクリプトーム、プロテオームデータを統合した。
• 臨床転帰との関連を調べるために患者生存率および遺伝子発現データを解析した。

結論:

• メラノーマにおけるp73アイソフォーム特異的なDNA結合およびcoTFリクルートメントの包括的な参照マップを作成した。
• p73アイソフォームががん進行に影響を与える異なる転写プログラムを調整することを示した。
• がんにおけるp73アイソフォームの影響をモデル化するためのワークフローを確立し、AIベースの個別化療法への応用可能性を示した。