SARS-CoV-2融合ペプチドを標的とするペプチド阻害剤のスクリーニング：ミラーコンビナトリアルファージディスプレイおよびヒトプロテオームファージディスプレイの使用

科学分野:

• ウイルス学
• 生化学
• 創薬

背景:

• コロナウイルスの保存されたスパイク融合ペプチド（FP）は、広域スペクトル抗ウイルス療法の潜在的な標的となります。
• パンコロナウイルス阻害剤の開発には、保存されたウイルス機構を破壊できる分子の同定が必要です。

研究 の 目的:

• 保存されたSARS-CoV-2スパイク融合ペプチド（FP）を標的とする新規ペプチド阻害剤を同定すること。
• パンコロナウイルス阻害活性を持つペプチドを発見するためにファージディスプレイライブラリを探索すること。

主な方法:

• SARS-CoV-2 FPに対するランダム7-merペプチドライブラリ（NEB PhD-7-mer）のスクリーニング。
• 同定されたペプチドのプロテアーゼ耐性D-ペプチドとしての合成。
• ヒトの無秩序領域由来のプロテオーム由来ファージディスプレイライブラリのスクリーニング。
• 結合相互作用を解明するための分子動力学構造モデリング。

主要な成果:

• ランダムライブラリ由来の10個のD-ペプチドは、細胞培養におけるSARS-CoV-2感染を阻害しませんでした。
• OTUD1由来の重複する14merペプチド2つがプロテオームライブラリから同定されました。
• OTUD1配列に基づく合成ペプチドは、ウイルス侵入を著しく阻害しませんでした。
• 分子モデリングにより、OTUD1ペプチドとFPとの間に安定した結合様式が明らかになり、将来の阻害剤設計の可能性が示唆されました。

結論:

• ファージディスプレイ戦略は、直接的な阻害剤をもたらしませんでしたが、FP破壊剤の計算モデルの開発を促進しました。
• 本研究は、構造的洞察に基づいた将来のパンコロナウイルスFP阻害剤の設計の基礎を提供します。