乳癌および甲状腺癌における共通の病原性および予後予測バイオマーカーを明らかにする統合単一細胞およびバルクトランスクリプトーム解析

科学分野:

• 腫瘍学
• バイオインフォマティクス
• 分子生物学

背景:

• 乳癌（BC）および甲状腺癌（TC）は、罹患率が増加しているホルモン調節性の悪性腫瘍である。
• それらの併発の根底にある分子メカニズムは、よく理解されていない。

研究 の 目的:

• BCおよびTCの共通の病原性を解明すること。
• 両方の癌に対する共通の予後予測バイオマーカーおよび治療ターゲットを特定すること。

主な方法:

• 単一細胞およびバルクRNAシーケンスデータの統合バイオインフォマティクス解析。
• 機能的濃縮、単一細胞トランスクリプトーム、CNV、NMF、およびWGCNA解析が実施された。
• 機械学習を用いた予後予測シグネチャ構築と、検証のための機能的アッセイ。

主要な成果:

• JAK-STATシグナル伝達経路とサイトカイン-サイトカイン受容体相互作用が、共通の病原性メカニズムとして特定された。
• 主要な遺伝子発現モジュール（MP2、MP4、MP5）および細胞集団（SFRP2+線維芽細胞、HLA_DPB1+骨髄細胞）が、両方の癌において重要であった。
• SMR3Bは、増殖、遊走、浸潤に影響を与える共通の予後予測遺伝子として検証された。

結論:

• BCおよびTCの共通の分子メカニズムに関する包括的な洞察。
• SMR3Bは、両方のリスクを持つ患者にとって有望な予後予測バイオマーカーおよび治療ターゲットである。