二分脊椎に特異的なユニークな神経組織の適切な代理組織を特定するためのマルチ組織DNAメチル化分析

科学分野:

• エピジェネティクス; ヒト遺伝学; 発達生物学

背景:

• 二分脊椎などの神経管閉鎖不全症は、DNAメチル化のようなエピジェネティックメカニズムの影響を受ける。; 二分脊椎によって影響を受ける神経系組織におけるDNAメチル化プロファイルに関するヒトでの研究は限られている。

研究 の 目的:

• 二分脊椎を有する乳児の硬膜組織におけるDNAメチル化プロファイルを評価する。; 二分脊椎研究におけるDNAメチル化分析の潜在的な代理組織として、全血および口腔スワブを評価する。

主な方法:

• 二分脊椎を有する27人の乳児から採取した硬膜組織、全血、口腔スワブのDNAメチル化を測定した。; DNAメチル化プロファイリングには、Illumina Infinium MethylationEPIC BeadChipアレイを使用した。

主要な成果:

• 硬膜組織と、全血（1555個の関連）および口腔スワブ（920個の関連）の両方との間で、DNAメチル化の有意な相関が見られた。; FDR調整後、CpG部位のかなりの割合で、硬膜組織と全血（33%）または口腔スワブ（27%）との間で有意な差次的メチル化を示さなかった。

結論:

• 硬膜組織が入手できない場合、DNAメチル化研究において全血および口腔スワブは硬膜組織の実行可能な代理として機能することができる。; 神経管閉鎖不全症の病因におけるエピジェネティック要因をさらに調査し、これらの所見を検証するためには、より大規模なコホートによるさらなる研究が必要である。