Propionibacterium freudenreichii J117のゲノムデータは,生乳チーズからの機能的な株である

科学分野:

• 微生物学とゲノミクス
• 食品科学と技術 食品科学と技術

背景:

• Propionibacterium freudenreichiiは,発酵食品で使用される食品グレードの細菌です.
• 株J117は,共同発酵を通じて,植物性発酵食品のビタミンB12含有量を高める可能性のために選択されました.

研究 の 目的:

• Propionibacterium freudenreichii株J117.の完全なゲノム配列を報告するために
• 菌株開発と食品アプリケーションにおける安全性評価のためのゲノム資源を提供すること.

主な方法:

• 無酸素培養からのゲノムDNA抽出.
• PacBio Sequel IIのロングリード技術を用いた全ゲノム配列決定.
• Improved Phased Assembler (IPA) によるゲノムアセンブリと,Baktaによるアノテーション.

主要な成果:

• P. freudenreichii J117の完全なゲノム配列は2つの円形の複製に組み立てられました.
• ゲノムアノテーションには,コード配列,RNA,CRISPR配列,偽遺伝子が含まれていました.
• 抗生物質耐性スクリーニングでは,プラズミドでコードされた耐性決定因子が見つかりませんでした.

結論:

• J117ゲノム配列は,比較ゲノミクスと機能分析のための貴重な参考資料を提供します.
• 移動性抗生物質耐性遺伝子の欠如は,発酵食品に株J117を安全に適用することを支持しています.
• このデータセットは,ビタミンB12含有量の増加など,栄養価が向上した食品の開発を容易にする.