未診断のショートリードゲノム配列解析後の包括的な再分析の診断結果,原因不明の症の乳児における

科学分野:

• 小児神経学について
• クリニカルゲノミクス 臨床ゲノミクス
• エピレプシー 遺伝学

背景:

• 幼児性は高い発症率と著しい罹病率/死亡率を示しています.
• 幼児のエピレプシーの多くの症例は,最初のゲノムシーケンシングの後,遺伝学的に未解決のままです.
• 以前の非診断的ゲノム配列解析を再分析した診断的得点は,ほとんど不明です.

研究 の 目的:

• 原因不明のを持つ乳児におけるゲノムシーケンシングデータの包括的な再分析による診断的得点を決定する.
• この小児集団における再分析結果の臨床的有用性を評価する.

主な方法:

• 原因不明のエピレプシーまたは複雑な発熱発作の乳児を対象としたコホート研究.
• 176人の乳児とその両親からの非診断臨床的急速ゲノム配列決定データを再分析した.
• 複数のバイオインフォマティクスパイプラインが使用され,結果が臨床的に確認されました.

主要な成果:

• 再分析の結果,診断率は5.1%上昇し,全体的な診断率は46.5%に上昇した.
• 新しい診断には,新しい変種 (SNVs,構造的,繰り返し拡張,モザイク) と,新しい証拠で不確実な重要性を持つ変種が含まれていました.
• 特定されたすべての診断は,臨床的有用性を示した.

結論:

• 非診断的なゲノムシーケンシングの包括的な再分析は,説明不能のエピレプシーを持つ乳児にとって価値があります.
• 再分析は1~2年以内に,原因不明のエピレプシーを持つ子どもの日常的なケアに導入する必要があります.
• 臨床ゲノムシーケンシングは,複雑でコード化しない変異を検出するために拡張されるべきです.