トランスクリプトミックのプロファイリングにより,Apostichopus japonicusの成長の相違の背後にあるメカニズムが明らかになりました
Shuai Chang1, Abudula Abulizi2, Xiaoxiao Huang2
1Key Laboratory of Mariculture & Stock Enhancement in North China's Sea, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, College of Fisheries and Life Science, Dalian Ocean University, Dalian, 116023, China; State Key Laboratory of Freshwater Ecology and Biotechnology, Hubei Hongshan Laboratory, The Innovation Academy of Seed Design, University of Chinese Academy of Sciences, Institute of Hydrobiology, Chinese Academy of Sciences, Wuhan, China.
海の成長は著しく変化しています. 縮小した海 (SG) は,正常な成長 (NG) の個体とは異なり,筋肉と細胞骨格の遺伝子発現が変化し,補償メカニズムを示唆しています. 薬草化合物は,成長問題を軽減するのに役立ちます.
科学分野:
- マリン・バイオロジー マリン・バイオロジー
- 水産養殖は水産養殖である.
- 分子生物学は分子生物学である.
背景:
- 海 (Apostichopus japonicus) は,同一の栽培下では,著しい成長率の変動を示しています.
- 海のサブセットは"成長停滞"のフェノタイプを示し,その結果,バイオマスが劇的に減少します.
- この相違は,差異的な成長の基礎となる分子機構を理解することを必要とします.
研究 の 目的:
- Apostichopus japonicus.の成長分岐の分子基礎を調査する.
- 正常な成長と成長の停滞に関連した異なる発現遺伝子 (DEGs) を特定する.
- 海の成長遅延を緩和するための潜在的な治療目標を探求する.
主な方法:
- 正常成長 (NG) と成長阻害 (SG) のApostichopus japonicus.の体壁組織のトランスクリプトミックプロファイリング
- 重要な分子プレーヤーを特定するための差異性遺伝子発現分析.
- 分子発見を物理的構造と相関させるため,筋肉組織の組織学的検査.
主要な成果:
- NGとSGの個体間で816の異なる発現遺伝子 (DEG) が特定されました.
- NG個体は,成長促進遺伝子 (例えば,HGFR,RAS) のアップレギュレーションを示した.
- SGの個体は,筋肉と細胞骨格の遺伝子 (例えば,ACTG1,MYHC,TITIN,FLNB) のアップレギュレーションを示し,異常な組織構造と補償メカニズムを示した.
結論:
- 海の成長の差異は,特に成長促進および筋肉/細胞骨格経路における異なる遺伝子発現と関連しています.
- A. japonicusの成長阻害は,生産的な成長ではなく,乱れた細胞プロセスに関連しています.
- 伝統的な中国医学の化合物は,養殖における成長遅延に対処するために,重要なシグナル伝達経路 (HGFR,RAS) を調節する可能性を示しています.
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