バクテリオシン産生菌Lactococcus lactis亜種の完全なゲノム配列について DOME 6301は,潜在的な口腔病原体制御アプリケーションを持つ

科学分野:

• 微生物学 微生物学とは
• ゲノミクスゲノミクスとは
• バクテリア学 バクテリア学

背景:

• ラクトコッカス・ラクティス (Lactococcus lactis) の亜種である. 牛乳から分離されたラクティスDOME 6301は,口腔病原体に対する抗微生物特性を有しています.
• 経口病原体であるStreptococcus mutans,Prevotella intermedia,およびFusobacterium nucleatumは,重大な健康上の懸念を提起しています.

研究 の 目的:

• Lactococcus lactis DOME 6301.1.の全ゲノムシーケンシングとアノテーションをデノボで行うために
• 抗微生物化合物の生成,炭水化物の代謝,および潜在的な毒性の要因に責任を負う遺伝子を特定する.
• プロバイオティクスの候補者としてのL. lactis DOME 6301の可能性を評価する.

主な方法:

• PacBio RS IIプラットフォームを使用した全ゲノムシーケンシング.
• De novo ゲノムアセンブリとアノテーション.
• 遺伝子機能を特定するためのバイオ情報分析.

主要な成果:

• L. lactis DOME 6301のゲノムは2,532,858 bpで,G+C含有量は35%で,3つのコンティグに組み込まれています.
• アノテーションでは,2469のタンパク質コード配列,22のrRNA遺伝子,78のtRNA遺伝子を特定しました.
• 複雑な炭水化物の利用 (セルロース,キシロースなど) に関する遺伝子が検出されました. ),ニシンZバクテリオシン合成,抗菌剤耐性,ヘモリシン,およびエンテロトキシン.

結論:

• ゲノム解析は,L. lactis DOME 6301.1の代謝能力と潜在的な応用に関する洞察を提供します.
• バクテリオシン合成と抗菌剤耐性のための遺伝子の存在は,プロバイオティクスの可能性をサポートします.
• ゲノムの理解は,L. lactis DOME 6301を口腔衛生を含む特定の下流アプリケーションのために選択するのに役立ちます.