染色体のdif部位および関連モジュールがAcinetobacter sp.で特定されました. 抗生物質耐性の水平移転を推進する

科学分野:

• 微生物学 微生物学とは
• 遺伝学 遺伝学とは
• 分子生物学は分子生物学である.

背景:

• 抗生物質耐性遺伝子 (ARG) は,アシネトバクテルのプラズミドの移動性遺伝子要素 (MGE) に多く見られます.
• XerCDサイト固有の再結合 (XerCD SSR) システムは,これらのARGの転送を容易にする.
• Acinetobacterにおける追加の染色体ディフライクサイトが,ディフモジュールを形成し,遺伝子転送を促進する役割は不明でした.

研究 の 目的:

• アチネトバクテルの染色体異型部位の存在と機能を調査する.
• これらの部位が染色体diffモジュールと関連しているかどうかを判断する.
• これらのモジュールの水平遺伝子転送と抗生物質耐性における役割を理解する.

主な方法:

• メロペネム耐性アシネトバクテリア菌株M10.の分離
• オックスフォード Nanopore プラットフォームを使用して全ゲノムシーケンシング (WGS).
• 平均ヌクレオチド同一性 (ANI) と,種の識別のためのデジタルDNA-DNAハイブリダイゼーション (dDDH).
• 18種類の抗生物質に対する抗菌感受性試験.
• dif と pdif サイトを特定するためのBLAST 分析.

主要な成果:

• Acinetobacter sp. の染色体とプラズミドにARG,IS要素,機能遺伝子を含んだ多数のXerモジュールを特定しました. 菌株M10. 菌株M10. 菌株M10. 菌株M10. 菌株M10. 菌株M10. 菌株M10.
• これらのモジュール内の耐性遺伝子と耐性フェノタイプとの関連が確認されています.
• 染色体diffサイト/モジュールとプラズミド媒介のpdifサイト/モジュールとの間で高い類似性 (>99%) が発見されました.
• Xerサイトが染色体およびプラズミド媒介のdifモジュール島に集結していることが観察され,これは公的なAcinetobacterプラズミドゲノムでよく見られる.
• Acinetobacterの染色体とプラズミッドの間の遺伝子フローが示唆されています.

結論:

• Acinetobacterの追加の染色体diff-likeサイトは,プラズミド媒介のpdifモジュールと同様に,diffモジュール形成に関与している可能性が高い.
• これらの染色体部位は,主に染色体二重分子の解像度のためではないかもしれません.
• 染色体およびプラズミドによるディフモジュールは,水平遺伝子転送において重要な役割を果たし,抗生物質耐性の広がりに寄与する.