Jove
Visualize
お問い合わせ
JoVE
x logofacebook logolinkedin logoyoutube logo
JoVEについて
概要リーダーシップブログJoVEヘルプセンター
著者向け
出版プロセス編集委員会範囲と方針査読よくある質問投稿
図書館員向け
推薦の声購読アクセスリソース図書館諮問委員会よくある質問
研究
JoVE JournalMethods CollectionsJoVE Encyclopedia of Experimentsアーカイブ
教育
JoVE CoreJoVE BusinessJoVE Science EducationJoVE Lab Manual教員リソースセンター教員サイト
利用規約
プライバシーポリシー
ポリシー

関連する概念動画

RNA-seq03:21

RNA-seq

12.2K
RNA sequencing, or RNA-Seq, is a high-throughput sequencing technology used to study the transcriptome of a cell. Transcriptomics helps to interpret the functional elements of a genome and identify the molecular constituents of an organism. Additionally, it also helps in understanding the development of an organism and the occurrence of diseases. 
Before the discovery of RNA-seq, microarray-based methods and Sanger sequencing were used for transcriptome analysis. However, while...
12.2K
Overview Of Cell Separation And Isolation01:20

Overview Of Cell Separation And Isolation

7.7K
Cell separation was first achieved in 1964 by S. H. Seal, who separated large tumor cells from the smaller blood cells using filtration. Two years later, Pohl and Hawk performed experiments on how cells respond differently to a nonuniform electric field based on the cell type. Such observations were the inception of cell separation methods, which allow isolating a single cell type from a heterogeneous sample.
7.7K

こちらも読む

関連記事

共著者、ジャーナル、引用グラフによってこの研究に関連する記事。

並び替え
Same author

Competing programs shape cortical sensorimotor-association axis development.

Nature·2026
Same author

Bonding character and octahedral geometry as key determinants of solute miscibility in Ir-based oxides.

Nature communications·2026
Same author

Post-Synthetic Modification of the C═C Linkage in a Vinylene-Linked COF for ROS-Mediated Enamine Dimerization.

Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)·2026
Same author

Polyketide synthase-like functionality acquired by plant fatty acid elongase.

Science advances·2026
Same author

scDecorr: feature decorrelation based representation learning enables self-supervised alignment of multiple single-cell experiments.

Scientific reports·2026
Same author

Impact of Transfusion Dependence on Clinical and Economic Burden in Patients with Lower-Risk Myelodysplastic Syndromes: A 28-Year Retrospective Study.

Journal of blood medicine·2026

関連する実験動画

Updated: Feb 20, 2026

Single-cell RNA-Seq of Defined Subsets of Retinal Ganglion Cells
11:26

Single-cell RNA-Seq of Defined Subsets of Retinal Ganglion Cells

Published on: May 22, 2017

14.4K

SwarmMAP:単細胞配列データにおける分散型細胞型アノテーションのためのスワーム学習

Oliver Lester Saldanha1,2, Vivien Goepp3, Kevin Pfeiffer1

  • 1Else Kroener Fresenius Center for Digital Health, Technical University Dresden, Dresden, Saxony, Germany.

NPJ systems biology and applications
|February 18, 2026
PubMed
まとめ

SwarmMAPはSwarm Learningを使用して,単細胞のトランスクリプトミアデータからセル型アノテーションを自動化し,プライバシーを保護します. この分散型アプローチは,多様なデータセットで高い精度を達成し,細胞生物学研究の再現性とスケーラビリティを改善します.

さらに関連する動画

Droplet Barcoding-Based Single Cell Transcriptomics of Adult Mammalian Tissues
10:12

Droplet Barcoding-Based Single Cell Transcriptomics of Adult Mammalian Tissues

Published on: January 10, 2019

19.1K
Author Spotlight: Isolating and Analyzing Intestinal Cells of Zebrafish Larvae for Investigating Transcriptomic Aspects of Gastrointestinal Development
06:36

Author Spotlight: Isolating and Analyzing Intestinal Cells of Zebrafish Larvae for Investigating Transcriptomic Aspects of Gastrointestinal Development

Published on: November 10, 2023

2.8K

関連する実験動画

Last Updated: Feb 20, 2026

Single-cell RNA-Seq of Defined Subsets of Retinal Ganglion Cells
11:26

Single-cell RNA-Seq of Defined Subsets of Retinal Ganglion Cells

Published on: May 22, 2017

14.4K
Droplet Barcoding-Based Single Cell Transcriptomics of Adult Mammalian Tissues
10:12

Droplet Barcoding-Based Single Cell Transcriptomics of Adult Mammalian Tissues

Published on: January 10, 2019

19.1K
Author Spotlight: Isolating and Analyzing Intestinal Cells of Zebrafish Larvae for Investigating Transcriptomic Aspects of Gastrointestinal Development
06:36

Author Spotlight: Isolating and Analyzing Intestinal Cells of Zebrafish Larvae for Investigating Transcriptomic Aspects of Gastrointestinal Development

Published on: November 10, 2023

2.8K

科学分野:

  • コンピュータ生物学 コンピュータ生物学
  • ゲノミクスゲノミクスとは
  • バイオインフォマティックス

背景:

  • 単細胞のトランスクリプトミックプロファイリングは,組織異質性を理解するために不可欠な大規模なデータセットを生成します.
  • 手動のセル型アノテーションはボトルネックであり,劣った再現性とスケーラビリティに苦しんでいます.
  • データプライバシーの懸念は,ヒト単細胞データセットの共同分析を妨げています.

研究 の 目的:

  • セル型アノテーションのための標準化され,自動化され,プライバシーを保護する方法を開発する.
  • スワーム・ラーニングを活用して,細胞型分類モデルの分散型トレーニングを行う.
  • 複数の組織タイプにおけるSwarmMAPの性能とスケーラビリティを評価する.

主な方法:

  • SwarmMAPを開発し,分散型機械学習のためにSwarm Learningを適用するフレームワークを開発しました.
  • 訓練された細胞型分類モデル,参加センター間の原始データ交換なし.
  • 心臓,肺,乳房の単細胞RNAシーケンシングデータセットに関する検証されたSwarmMAP.

主要な成果:

  • SwarmMAPは,0.93 (心臓),0.98 (肺),0.88 (乳房) の高いF1スコアを達成しました.
  • スワーム・ラーニング・モデルは,中央集権的なトレーニングと比較して平均0.907のパフォーマンスを示しました.
  • データセットの数が増えたことで,予測の精度が向上し,細胞型分類能力が拡大しました.

結論:

  • Swarm Learningは,単細胞ゲノミクスにおける細胞型アノテーションのための効果的な自動化されたソリューションを提供しています.
  • SwarmMAPは,スケーラビリティとプライバシーの課題に対処し,より広範なデータ統合を促進します.
  • SwarmMAPのフレームワークは,研究機関全体で再現可能でスケーラブルな細胞型分類を促進します.