豚屠殺場における表面関連細菌生態とレジストームのダイナミクスの縦断分析

科学分野:

• 食品安全マイクロバイオロジー
• 抗生物質耐性菌は,抗生物質耐性菌として存在します.
• 環境微生物学 環境微生物学

背景:

• 屠殺場は病原菌の伝播と抗菌剤耐性 (AMR) の拡散のための重要なコントロールポイントです.
• 屠殺場における微生物のコミュニティとそのレジストームを理解することは,食品の安全性にとって不可欠です.
• サルモネラ・タイフィムリウムとその変種は,豚肉生産部門において重大な懸念事項である.

研究 の 目的:

• 豚屠殺場における表面関連微生物の細菌群とレジストームプロフィールを調査する.
• 微生物の組成とAMR遺伝子の変化を2年間の期間 (2017年−2019年) で分析する.
• 屠殺場環境内の抵抗性遺伝子の潜在的な貯蔵庫を特定する.

主な方法:

• Salmonella enterica serovar Typhimurium菌株と表面微生物のサンプルを収集する.
• サルモネラ単離体の全ゲノムシーケンシング.
• バクテリアコミュニティとレジストーム分析のための16S rRNAメタバーコーディングとショットガンメタゲノミクス.

主要な成果:

• バクテリア群はモラクセラceae家族によって支配され,比較的安定していました.
• アップストリーム段階 (脱毛) では,アミノグリコシドおよびテトラサイクリン耐性遺伝子がアシネトバクター,エシェリキア,クロストリジウムに関連していることが示されました.
• ダウンストリーム段階 (赤類) では,抗生物質およびバイオシードに対する耐性遺伝子の多様性と豊富性が増加し,特にβ-ラクタムおよびカルバペネムに対する耐性があり,Acinetobacterは潜在的な耐性遺伝子の貯蔵体として特定されました.

結論:

• 屠殺所の環境は,安定した組成を持つ独特の,サイト固有の細菌集団を宿している.
• アチネトバクテリアの種は,抗生物質とバイオシド耐性遺伝子の蓄積と潜在的拡散に重要な役割を果たしています.
• これらの発見は,食物連鎖における病原体とAMRの動態を制御する上で屠殺所の衛生の重要性を強調しています.