統合されたフォスフォプロテオミクスは,パラトゲネシスにおけるオートファギーのキナーゼシグナル伝達とリンクするTGFβ依存のフォスフォリレーションイベントを特定します

科学分野:

• クラニオファシアル発達の研究
• 細胞の信号伝達経路は,
• 分子生物学は分子生物学である.

背景:

• 口腔裂け (Cleft palate,CP) は,常見の頭蓋骨・顔面の先天性欠陥である.
• 変形成長因子β (TGFβ) 経路は,の発達において極めて重要です.
• マウスの胚性 palatal mesenchyme (MEPM) 細胞の調節におけるオートファギーの役割とそのTGFβシグナル伝達との相互作用は十分に理解されていません.

研究 の 目的:

• パラトゲネシス中のオートファジーとTGFβシグナル伝達との相互作用を調査する.
• MEPM細胞におけるTGFβ誘発のフォスフォプロテオーム変化の背後にある分子メカニズムを解明する.

主な方法:

• palatal 発達中のタンパク質発現を評価するために,組織学的分析 (H&E, IHC) を行う.
• 濃縮された経路を特定するために,バルクRNAシーケンシング (BulkRNA-seq) を行います.
• TMTベースのフォスフォプロテオミクスは,TGFβ2処理されたMEPM細胞におけるタンパク質のリン酸化を分析する.

主要な成果:

• 臨界の palatal 融合段階において,オートファジーマーカー (Beclin 1, LC3) の発現が増加する.
• バルクRNA-seqでは,オートファジーとTGFβシグナル伝達経路の強化が示されました.
• フォスフォプロテオミクスは,多様に豊富に存在する多数のフォスフォペプチドと濃縮されたリン酸化モチーフを特定し,CSNK2A,MAPK,CDKを主要な調節体として強調した.
• 機能的エンリッチメント分析では,mTOR,MAPK,そしてオートファジー/ミトファジー経路が関与していた.

結論:

• TGFβ2は,Smadから独立した経路を通じて,MEPM細胞のフォスフォプロテオームを著しく変化させます.
• この研究は,法定的なSmadカスケードを超えて,口腔特異的なフォスフォシグナリングに関する知識を拡大します.
• TGFβ媒介の palatogenesis に関する新しいレギュレータと経路が特定されました.