偽陽性HIV NATを引き起こすレンチウイルス転送プラズミド汚染のバイオインフォマティック識別は,高通量分子スクリーニングラボでの高通量分子スクリーニングラボでの結果になります

科学分野:

• 分子生物学は分子生物学である.
• ウイルス学 ウイルス学 ウイルス学
• 公衆衛生は公衆衛生である.

背景:

• 高通量PCRスクリーニングは,血液の安全性にとって極めて重要です.
• HIV偽陽性の原因不明の増加は,通常の血液検査中に発生しました.
• この事件は,血液成分の安全性を維持するために緊急の調査を必要とした.

研究 の 目的:

• 血液検査中に偽HIV反応性の有意な増加の原因を特定する.
• 実験室の汚染の源と性質を調査する.
• スクリーニング環境におけるHIV由来レンチウイルスベクトルの影響を評価する.

主な方法:

• 汚染を検知するための環境スランプ.
• 病原体識別のためのアンプリコン次世代シーケンシング (NGS).
• オーダーメイドのバイオインフォマティクス分析で,配列を区別する.
• 汚染源を隣接する研究所まで追跡する.

主要な成果:

• 広範な実験室汚染が確認され,392個のスワンプのうち356のスワンプが陽性でした.
• 汚染源は,HIV-1 LTRを含むレンチウイルス伝達プラズミドとして特定されました.
• 汚染物質は,ドナー,受容者,またはスタッフにリスクをもたらさなかった.

結論:

• HIVに由来するレンチウイルスベクトルは,敏感なPCRアッセイにおいて偽反応を引き起こす可能性があります.
• 施設の設計と運用プロトコルは,汚染の拡散を防ぐために,プラズミド製造において非常に重要です.
• この事件は,高通量スクリーニングラボでの強力な汚染制御の重要性を強調しています.