複製のタイミングは,インターフェーズエウクロマチンの2つのコンパートメントの核アーキテクチャを明らかにします

科学分野:

• ゲノミクスゲノミクスとは
• 細胞生物学 細胞生物学
• エピジェネティクス エピジェネティクス

背景:

• 複製タイミング (RT) は,S段階のゲノム複製を制御する.
• 以前のモデルでは,クロマチンの凝縮とRTに基づいたトウモロコシのエウクロマチンのサブコンパートメンタライゼーションが示唆されていました.
• 細胞サイクル全体にわたってこの区画化が持続するかどうかは不明でした.

研究 の 目的:

• トウモロコシ euchromatinの空間的組織を調査するために.
• 提案されたサブコンパートメントが細胞サイクル全体にわたって持続するかどうかを判断する.
• トウモロコシのエウクロマチン"A"コンパートメントをRTと空間組織に基づいて再定義する.

主な方法:

• Hi-Cを使用した全ゲノム相互作用データ.
• 3D FISH塗装を使用してクロマチンの組織を直接視覚化.
• 複製のタイミングに関連したエピジェノミックシグネチャーの分析.

主要な成果:

• Hi-Cは,早期S (ネガティブ・イソレーション,長距離接触) と中期S領域の異なる相互作用パターンを明らかにした.
• 初期のS領域は,開いた,転写的に活性な染色素と強く相関していた.
• 3D FISHが確認したEarly-SとMiddle-Sの領域は,インターフェーズ全体で隣接し,重複しない核亜領域を占めている.

結論:

• トウモロコシエウクロマチン"A"コンパートメントは,空間的に異なる2つのサブコンパートメントで構成されています.
• これらのサブコンパートメントは,ゲノムに沿った高周波RTトランジションによって定義されます.
• RTは,ゲノム組織を定義する重要な特徴であり,染色体テンプレート化されたプロセスに影響を及ぼします.