インドのコミュニティの環境における抗菌剤耐性尿病原体のフェノタイプとゲノタイプの特徴付け:多中心的横断的研究

科学分野:

• 微生物学 微生物学とは
• ゲノミクスゲノミクスとは
• 感染症 感染症は感染症です.

背景:

• コミュニティで発症した尿路感染症 (CA-UTIs) は,公衆衛生上の重大な懸念事項である.
• 尿病原体の発生率と遺伝的特性を理解することは,効果的な治療に不可欠です.

研究 の 目的:

• インドでCA-UTIsを引き起こす尿病原体の有病率とゲノム特性を決定する.
• これらの病原体における抗菌剤耐性 (AMR) と毒性の遺伝子を特徴づける.

主な方法:

• インドにおける多中心的横断的コミュニティ研究.
• 泌尿病原体の識別と抗菌感受性試験.
• ゲノム特徴化のための全ゲノム配列解析 (WGS),AMRとウイルス性遺伝子,および配列型 (ST) を含む.

主要な成果:

• 標本の11.8%で有意な細菌尿が検出された;エシェリキヤ大腸 (63%) とクレブシエラ肺炎 (15.7%) が優勢であった.
• 拡張スペクトルベータラクタマース (ESBL) 産生,多剤耐性 (MDR),およびE. coliとK. pneumoniaeの両方のカルバペネム耐性の高い罹患率.
• ゲノム解析により,BlaCTX-M-15,BlaNDM-5.5のような主要なAMR遺伝子を携えている高リスククローン (例えば,E. coli ST131,ST1193;K. pneumoniae ST15,ST16,ST231) が特定されました.

結論:

• インド人コミュニティの環境における薬物耐性,高リスクの尿病原体クローンの広範な存在.
• 常規のAMR監視と慎重な抗生物質選択を含む多面的なアプローチが緊急に必要である.
• WGSは,E. coliにおけるST131およびST1193のような,耐性に関連した特定の系統とプラズミッドを特定しました.