フィロゲノミクスの種の境界は,アマニタ・ジャックスニーの系統進化の独特のペースと方法を明らかにしています
Santiago Sánchez-Ramírez1, Rodham E Tulloss2, Simona Margaritescu3
1Department of Ecology and Evolutionary Biology, University of Toronto, Toronto, Ontario, Canada; Department of Natural History, Royal Ontario Museum, Toronto, Ontario, Canada.
フィロゲノミクス分析により,アマニタ・ジャックソニー複合体内の7つの異なる種が明らかになり,以前の分類に異議を唱えた. この研究は,北米のエクトミコリザル菌の真菌種の境界線と多様化を明確にしています.
科学分野:
- ミコロジー菌類学
- 進化生物学の進化生物学について
- ゲノミクスゲノミクスとは
背景:
- Amanita jacksonii s.l.における種分岐について 形態学的および分子学的データが不十分であるため,難しいです.
- 伝統的な方法は,この群のキノコを形成する真菌の明確な分類解明を提供できませんでした.
研究 の 目的:
- アマニタ・ジャックソニー複合体内の種の境界を,系統学的アプローチを用いて解明する.
- 北米におけるこれらのエクトミコリザル菌の多様化パターンと進化史を調査する.
主な方法:
- 63個の標本から100以上の遺伝子ロシのエクソン標的配列を解析.
- 高品質の30342の変種と172のロシ (平均2.5Kb) を分析した.
- 分子年代測定と並行して,集団構造とコアレスセントベースの種の区切り方法の適用.
主要な成果:
- 堅固な系統遺伝学的な証拠は,複合体内の7つの異なる種を支持しています.
- 明確な地理的な人口構造はメソアメリカ高地で見られたが,米国の低地森林では見られなかった.
- 分子年代測定は,多様化がプレオセーンで始まったことを示唆し,ほとんどの種が200万年の窓内で行われた.
- シンパトリックの低地種は,アロパトリックの高地種よりも深い遺伝的差異を示しています.
結論:
- 系統遺伝学は,形態学的に似ている真菌の種の境界を解決することに成功しています.
- Amanita jacksonii s.s.は,アパラチア地域とカナダ東部に限定されていることが確認されています.
- 多様化パターンは,共感的な低地種の潜在的プレジゴティックバリアと,A. jacksonii s.s.の氷河期後の拡大を示唆しています.
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