ヒト化NSGマウスにおける正確な遺伝子発現評価のための種間配列不一致に基づくハウスキーピング遺伝子の2段階アルゴリズム選択

科学分野:

• 生物医学研究;免疫学;遺伝学

背景:

• ヒト化マウスモデルにおける正確な遺伝子発現正規化は極めて重要です。;マウス内のヒト細胞に適したハウスキーピング遺伝子（HG）を選択することは、種間差のために困難です。

研究 の 目的:

• ヒト末梢血単核球（hPBMC）ヒト化NSGマウスにおける遺伝子発現分析のための、安定した組織特異的なハウスキーピング遺伝子を同定および検証すること。;ヒト化マウスモデルにおけるHG選択のための堅牢なアルゴリズムを開発すること。

主な方法:

• 5つのアルゴリズムを使用して、ヒトPBMCにおける発現安定性について10の候補HGを評価しました。;ヒトおよびマウスの細胞株間の有意な種間差を持つ遺伝子を同定しました。;hPBMCヒト化NSGマウスでinvivo組織特異的な発現分析を実施しました。

主要な成果:

• 種間差と発現安定性を優先する2段階アルゴリズムを開発しました。;組織特異的なHGを推奨しました：ACTB（心臓）、EEF2（肝臓、脾臓）、SDHA（肺、腎臓）、TFRC（hPBMC）。;EEF2とSDHAは肝臓に適していました。;EEF2はサイトカインmRNA分析で優れた性能を示しました。

結論:

• ヒト化マウスモデルにおけるHG選択には、種および組織特異的なパターンが重要です。;推奨されるHGは、遺伝子発現分析の精度と信頼性を向上させます。;この発見は、ヒト疾患研究のためのヒト化マウスモデルの有用性を向上させます。