DNAとRNAプロファイルのコンコンダンス分析: 精密腫瘍学のMDアンダーソンIMPACT2研究

科学分野:

• 腫瘍学 腫瘍学
• ゲノミクスゲノミクスとは
• 分子生物学は分子生物学である.

背景:

• DNAプロファイリングはがん治療の選択の標準ですが,RNAプロファイリングはまだ調査中です.
• IMPACT2研究 (NCT02152254) は,様々な腫瘍タイプにおけるがん治療の指針となる分子プロファイリングを評価した.

研究 の 目的:

• 癌患者のDNAとRNAの変異の間の関連性を調査する.
• 変化した発現を持つ遺伝子の数と全生存期 (OS) の関連性を調査する.
• DNAとRNAのプロファイリングの結果の一致性を評価する.

主な方法:

• 次世代DNAシーケンシングを含む分子プロファイリングは,IMPACT2試験の患者829人に実施されました.
• 253人の患者に対してRNAプロファイリングが行われました.
• DNAとRNAプロファイルの一致性が評価され,治療を受けた217人の患者でOSが分析されました.

主要な成果:

• 50人の患者は58の一致したDNAおよびRNAイベントを示し,そのうち41人が統計的に有意な一致を示した.
• 123の遺伝子ペアは,VEGFA過剰発現によるTP53変異を含む,ゲノムと発現の変化 (p <0.05) の間の有意な関連性を示した.
• 遺伝子発現が変化した≥6の遺伝子を持つ患者は,遺伝子発現が変化した0〜2 (9.8ヶ月) または3〜5 (11.9ヶ月) の患者と比較して,平均寿命が短かった (6.7ヶ月).

結論:

• RNAプロファイリングは,がん治療の選択における潜在的な有効性を示しています.
• 変化した発現 (≥6) を有する遺伝子の数の増加は,全体的な生存率の低下と関連しています.
• TP53変異とVEGFA過剰発現の間の観察された一致は,TP53変異がんにおけるベバシズマブに対する反応を明らかにする可能性がある.