SARS-CoV-2のゲノムデータ利用可能性における不平等と世界的な減少は、新たな変異株への対応を妨げる

科学分野:

• 公衆衛生
• ゲノム疫学
• 感染症監視

背景:

• ゲノム疫学は、感染症監視、特にSARS-CoV-2の監視に革命をもたらしました。
• COVID-19パンデミック初期のデータは、全ゲノムシーケンスの利用可能性における世界的な格差が著しいことを明らかにしました。
• これらの格差の持続と、公衆衛生緊急事態後のゲノムサーベイランスの低下は、定量化されていません。

研究 の 目的:

• 国別所得分類別のSARS-CoV-2シーケンスデータ利用可能性における格差を定量化すること。
• COVID-19公衆衛生緊急事態後のゲノムサーベイランスの低下を測定すること。
• これらの傾向が新たなウイルス変異株の検出と特徴付けに与える影響を評価すること。

主な方法:

• 2020年から2025年までのGISAIDプラットフォームにおけるSARS-CoV-2シーケンス提出の分析。
• 国別および世界銀行の所得分類別のデータ。
• 経時的なシーケンス提出傾向の定量化。

主要な成果:

• SARS-CoV-2シーケンス提出において、所得分類間で著しい格差が観察され、世界的な監視が妨げられました。
• ゲノムサーベイランス能力は、高所得国であっても、パンデミックのピーク時から大幅に低下しました。
• 高所得国におけるシーケンス提出数が5億7700万から5000万未満に減少したことは、監視能力の喪失を浮き彫りにしています。

結論:

• ゲノムデータの共有における持続的な格差は、世界的な感染症監視を脅かします。
• SARS-CoV-2ゲノムサーベイランスの低下は、新たなウイルス脅威の検出と特徴付け能力を低下させます。
• ゲノムサーベイランスプログラムとデータ共有インセンティブへの持続的な投資は、世界的な公衆衛生の安全保障に不可欠です。