成熟した海刺の卵細胞における重複配列の転写

科学分野:

• 分子生物学は分子生物学である.
• 発達生物学 発達生物学について
• ゲノミクスゲノミクスとは

背景:

• 交互に繰り返される配列 (IRS) は,真核生物のゲノムに豊富に存在する.
• 卵子細胞での彼らの発現は,早期の発達にとって極めて重要です.
• 海の卵細胞におけるIRSの転写を理解することは,ゲノム調節に関する洞察を提供します.

研究 の 目的:

• 成熟した海刺の卵細胞における短時間および長時間の間隔の繰り返し配列の発現を調査する.
• これらの転写された繰り返し配列の有病率と鎖表現を決定するために.
• トランスクリプトの普及率とゲノム再帰頻度とゲノム組織を相関させるため.

主な方法:

• 3H-DNAトレーサーの短 (数百の核酸) と長 (約. 2000ヌクレオチド) の重複配列をストロングイロセントロトゥス・パープラトゥスゲノムDNAから取り出した.
• これらのトレーサーを過剰な成熟卵細胞RNAとハイブリッド化する.
• トランスクリプトの有病率を判断するための運動学的分析.
• クローンされた9つの重複配列を卵細胞RNAで鎖分離およびハイブリッド化.
• 転写された繰り返し配列のゲノム組織の分析.

主要な成果:

• 短い繰り返しトレーサーの約80%と長い繰り返しトレーサーの約35%が卵細胞RNAとハイブリッド化しました.
• 最も重複する配列の両方の鎖に補完的なトランスクリプトが検出されました.
• トランスクリプトの有病率は,約10^3から卵細胞あたり10^5以上のコピーまで幅広く変化した.
• トランスクリプトの有病率は,ゲノムリートレーションの頻度とは無関係でした.
• 流行したトランスクリプトは,低ゲノム複製数 (ハプロイドゲノム1つあたり200個未満) を有する繰り返しファミリーから発生した.
• 流行するトランスクリプトファミリーのほとんどのメンバーは,単一コピー配列で散らばっています.

結論:

• 成熟した海刺の卵細胞は,その間隔の繰り返し配列の重要な部分を積極的に転写する.
• 短いと長いの両方の間隔された繰り返しの配列は,卵細胞RNAで表現されており,その流行率は異なります.
• トランスクリプトの流行は,ゲノム内の複製のコピー数と直接関連していないため,複雑な規制メカニズムを示唆しています.
• この発見は,オオゲネシス中の反復要素のダイナミックな表現とゲノム組織を強調しています.