チロノムス・テンタンスのバルビアーニのリング2のタンデムで繰り返される核酸塩基配列の変異体

科学分野:

• 分子生物学は分子生物学である.
• ゲノミクスゲノミクスとは
• 染色体生物学について

背景:

• バルビアーニ環 (Balbiani rings, BRs) は,活性遺伝子発現で知られているディプテラのポリテネ染色体上の大きな膨らみである.
• Chironomus tentansのBalbiani ring 2 (BR2) は主要な転写部位であるが,その重複するDNA要素は完全に特徴づけられていない.

研究 の 目的:

• キロノムス・テンタンスのバルビアーニ環2 (BR2) ロカス内の新しい繰り返しのDNA配列を特定し,特徴づけること.
• BR2領域で新たに発見されたタンデムリピートの構造とコピー番号を調査する.

主な方法:

• ヒトゲノムクローンのpCtBR2-2からChironomus tentansの唾液腺ポリテン染色体へのインシットウ・ハイブリダイゼーション.
• pCtBR2-2挿入体のDNA配列解析により,繰り返しの元素の核酸配列を決定する.
• ハプロイドゲノム毎の複製のコピー数を推定するための配列タイトレーション実験.

主要な成果:

• ゲノムクローンpCtBR2-2は,180 bpのタンデムで繰り返される核酸配列のほぼ4つのコピーを含んでいます.
• この180bpの重複は,以前に報告されたBR2の重複とは異なっており,ハプロイドゲノムあたり約70コピーの割合で存在する.
• 各180bpのリピートには,保存された90bpの内部非反復 (INR) セグメントと変数90bpの反復 (R) セグメントがあり,9bpのコンセンサスシーケンスから潜在的に進化しています.

結論:

• 特定された180bpのタンデムリピートは,BR2ロカス内の新しい繰り返しDNA要素を表しています.
• 配列の組織は,その繰り返しの潜在的な進化的経路を示唆する.
• これらの発見は,他のバルビアーニのリング遺伝子の多様で未確認の繰り返し配列の可能性を示しています.