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Rous サルコマウイルスの核酸配列

D E Schwartz, R Tizard, W Gilbert

    Cell
    |March 1, 1983
    PubMed
    まとめ

    私たちは,Prague C株のRous肉腫ウイルス (RSV) を配列化し,遺伝子の位置と重複を明らかにしました. 特定のDNA要素 (E) はRSV株間の位置によって異なっており,先祖の複製と削除を示唆しています.

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    科学分野:

    • ウイルス学 ウイルス学 ウイルス学
    • 分子生物学は分子生物学である.
    • ゲノミクスゲノミクスとは

    背景:

    • ルース・サーコマウイルス (RSV) は,鶏の腫瘍を引き起こすことが知られているレトロウイルスです.
    • RSVのゲノム組織を理解することは,ウイルスの複製と腫瘍発生の研究に不可欠です.
    • 以前の研究では,いくつかのRSV遺伝子を特徴づけましたが,特定の株の完全なゲノム配列データはありませんでした.

    研究 の 目的:

    • プラハC (Pr-C) 株のRSVの完全な核酸配列を決定する.
    • Pr-C RSV ゲノム内の gag,pol,env,src 遺伝子のコーディング領域を特定し,マッピングする.
    • 進化的関係を理解するために,Pr-CとSchmidt-Ruppin (SR-A) RSV株のsrc遺伝子を横切るゲノム配列を比較する.

    主な方法:

    • ルース肉腫ウイルスのプラハC株の全ゲノム配列解析.
    • 生物情報分析は,開かれた読み取りフレームを特定し,遺伝子機能 (gag, pol, env, src) を割り当てます.
    • Pr-CとSR-AのRSV株間の比較シーケンスの分析, src遺伝子を取り巻く領域に焦点を当てた.

    主要な成果:

    • Pr-C RSV株の完全な9312核酸配列が決定されました.
    • GAG,POL,ENV,SRC遺伝子のコーディング領域が割り当てられ,GAGはPOLと異なる読み取りフレームに配置された.
    • pol と env の遺伝子が重複していることが判明しました.
    • 153-ヌクレオチド要素 (E) は,Pr-C RSV の src 遺伝子の 3' に位置し,SR-A RSV の src 遺伝子の 5' に位置していた.

    結論:

    • Pr-C RSV ゲノム配列は,レトロウイルス研究のための包括的なリソースを提供します.
    • RSV株間のE要素の位置的差異は,進化の過程で遺伝子の複製と削除のメカニズムを示唆しています.
    • この発見は,ルース・サルコマウイルスのゲノム性可塑性および進化史に光を当てています.